RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560934.1

LINS1-210, Transcript of lines homolog 1, human

TSL 4

Gene LINS1, Length 562 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LINS1-210	ENST00000560934	ATL2	Q8NHH9	583 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	CPA5	Q8WXQ8	436 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	FAM84A	Q96KN4	292 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	TTC1	Q99614	292 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	PDGFD	Q9GZP0	370 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	FAN1	Q9Y2M0	1017 aa		5.9	□□□□□ -1.46
LINS1-210	ENST00000560934	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGEF28	Q8N1W1	1705 aa	Known RBP	5.9	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SIPA1L2	Q9P2F8	1722 aa	Predicted RBP	5.9	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PTCH1	Q13635	1447 aa		5.9	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	TULP4	Q9NRJ4	1543 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	EYA4	O95677	639 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	MME	P08473	750 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	BPI	P17213	487 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	IBSP	P21815	317 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	IGFBP6	P24592	240 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	GJA4	P35212	333 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CNGB1	Q14028	1251 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PHF19	Q5T6S3	580 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	OGFOD2	Q6N063	350 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PROSER1	Q86XN7	944 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ZCRB1	Q8TBF4	217 aa	Known RBP	5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ERCC4	Q92889	916 aa	Predicted RBP	5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	NOX5	Q96PH1	765 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ORAI2	Q96SN7	254 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	RNF38	Q9H0F5	515 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	IFT22	Q9H7X7	185 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SLC39A2	Q9NP94	309 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ATP8A1	Q9Y2Q0	1164 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CPS1	P31327	1500 aa		5.89	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	STRCP1	A6NGW2	1772 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	RASSF10	A6NK89	507 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	FOXP2	O15409	715 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PAX4	O43316	350 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	TGM5	O43548	720 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	KRT1	P04264	644 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	C1QTNF9	P0C862	333 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CYP2C8	P10632	490 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ATF3	P18847	181 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	LSS	P48449	732 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CDKN1C	P49918	316 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	STAT4	Q14765	748 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ATP13A4	Q4VNC1	1196 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CATSPERE	Q5SY80	951 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CD276	Q5ZPR3	534 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CC2D1A	Q6P1N0	951 aa	Predicted RBP	5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	LIPI	Q6XZB0	460 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ATG14	Q6ZNE5	492 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	B3GNT8	Q7Z7M8	397 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	TMEFF1	Q8IYR6	380 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	GBP4	Q96PP9	640 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	GORASP1	Q9BQQ3	440 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PCIF1	Q9H4Z3	704 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	TOMM22	Q9NS69	142 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SPO11	Q9Y5K1	396 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	LRRC7	Q96NW7	1537 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	QRICH2	Q9H0J4	1663 aa		5.88	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	hCG_2014768	A0A024R1R8	64 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ZEB2	O60315	1214 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CPE	P16870	476 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CDK11B	P21127	795 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	TMPRSS15	P98073	1019 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PFKP	Q01813	784 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SSPN	Q14714	243 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PRAMEF18	Q5VWM3	479 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	EFHB	Q8N7U6	833 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	NGDN	Q8NEJ9	315 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	WDR66	Q8TBY9	1149 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ASB15	Q8WXK1	588 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ZSWIM3	Q96MP5	696 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	EMC7	Q9NPA0	242 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	NGRN	Q9NPE2	291 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ACSS2	Q9NR19	701 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	UCKL1	Q9NWZ5	548 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ARHGAP28	Q9P2N2	729 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	NOP58	Q9Y2X3	529 aa	Known RBP	5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	KNSTRN	Q9Y448	316 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	IRAK3	Q9Y616	596 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ACE	P12821	1306 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	NCOA3	Q9Y6Q9	1424 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	NWD1	Q149M9	1564 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	KNDC1	Q76NI1	1749 aa		5.87	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	NKTR	P30414	1462 aa	Known RBP	5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	PPIP5K1	Q6PFW1	1433 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	LCHN	A4D1U4	455 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	NFIB	O00712	420 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	FYB1	O15117	783 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	ENO2	P09104	434 aa	Predicted RBP	5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	SDHA	P31040	664 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	MC4R	P32245	332 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	THBS2	P35442	1172 aa		5.86	□□□□□ -1.47
LINS1-210	ENST00000560934	GLRB	P48167	497 aa		5.86	□□□□□ -1.47

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.2 ms