RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557130.1

UBE2CP1-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 C pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene UBE2CP1, Length 554 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2CP1-201ENST00000557130 ACTN1P12814 892 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 CXCR5P32302 372 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 SOX5P35711 763 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 CAP2P40123 477 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 PTGER2P43116 358 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 CASP4P49662 377 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 HSD17B4P51659 736 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 GYS2P54840 703 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 CYP4A11Q02928 519 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 ARID5AQ03989 594 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 LDHDQ86WU2 507 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 CD302Q8IX05 232 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM178BQ8IXR5 827 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 C12orf56Q8IXR9 622 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 LRRC57Q8N9N7 239 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 USP38Q8NB14 1042 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 AGBL3Q8NEM8 1001 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 TPCN2Q8NHX9 752 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 ACER1Q8TDN7 264 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 WHAMMQ8TF30 809 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 HDAC7Q8WUI4 952 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 UIMC1Q96RL1 719 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 IWS1Q96ST2 819 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZNF577Q9BSK1 485 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 WDR18Q9BV38 432 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 TSPYL1Q9H0U9 437 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMEM206Q9H813 350 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM204AQ9H8W3 233 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 FRMPD4Q14CM0 1322 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 ARHGEF35A5YM69 484 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 SFI1A8K8P3 1242 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 RSPH10B2B2RC85 870 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 TCP10L2B9ZVM9 353 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 TULP2O00295 520 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 IPO5O00410 1097 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 CLIC2O15247 247 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 ICAM1P05362 532 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 ASNSP08243 561 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 TMEM253P0C7T8 217 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 RSPH10BP0C881 870 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 FDX1P10109 184 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 MYBL2P10244 700 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 ERCC3P19447 782 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 NMT1P30419 496 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 CHRNA5P30532 468 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 ECE1P42892 770 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 NOP2P46087 812 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 FMO5P49326 533 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 CETN1Q12798 172 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 CAMK2BQ13554 666 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 CUL1Q13616 776 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 EZH2Q15910 746 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 TCERG1LQ5VWI1 586 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 SPICE1Q8N0Z3 855 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 RASGEF1CQ8N431 466 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 TTLL6Q8N841 843 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 FAM76AQ8TAV0 307 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 PIGOQ8TEQ8 1089 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 MS4A14Q96JA4 679 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 FIZ1Q96SL8 496 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 MAF1Q9H063 256 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 UNC45AQ9H3U1 944 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 TBC1D22BQ9NU19 505 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 RPTORQ8N122 1335 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 GOLGA6CA6NDK9 693 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 KCNK3O14649 394 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 SHOX2O60902 331 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 PHACTR2O75167 634 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 PPFIA4O75335 1185 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 FTCDO95954 541 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 GLI1P08151 1106 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 GOLGA6DP0CG33 693 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 ZBTB48P10074 688 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 ARP10275 920 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 KRT13P13646 458 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 TNFAIP3P21580 790 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 GALCP54803 685 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 HADHBP55084 474 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 SKOR1P84550 965 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 SLC7A5Q01650 507 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 ENPEPQ07075 957 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 KCNA1Q09470 495 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 KIF22Q14807 665 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
UBE2CP1-201ENST00000557130 DCAF17Q5H9S7 520 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.9 ms