RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551441.5

CS-227, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 3

Gene CS, Length 636 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-227ENST00000551441 KRT17Q04695 432 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 RARS2Q5T160 578 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 EFCAB12Q6NXP0 572 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 PPP1R18Q6NYC8 613 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 RBM28Q9NW13 759 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 BARHL2Q9NY43 387 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 SPG21Q9NZD8 308 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 LZTS1Q9Y250 596 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 SAMM50Q9Y512 469 aa18.27■□□□□ 0.52
CS-227ENST00000551441 VPS13AQ96RL7 3174 aa18.27■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 WDR81Q562E7 1941 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 GOLGA8BA8MQT2 603 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 ZBTB43O43298 467 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 AP3B2Q13367 1082 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 LRRC43Q8N309 656 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 TMEM105Q8N8V8 129 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 RASGRP4Q8TDF6 673 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 CASP10Q92851 521 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 ADAMTS10Q9H324 1103 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 NR2E1Q9Y466 385 aa18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 KLF18A0A0U1RQI7 1052 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 FSD2A1L4K1 749 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 C2orf71A6NGG8 1288 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 CXCL14O95715 111 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 CES5AQ6NT32 575 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 NIPA1Q7RTP0 329 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 ASCL5Q7RTU5 278 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 SLC39A11Q8N1S5 342 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 SCLT1Q96NL6 688 aa18.25■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 HOXA2O43364 376 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 GALR2O43603 387 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 PSAPP07602 524 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 MTMR3Q13615 1198 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 TPRNQ4KMQ1 711 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 PRR16Q569H4 304 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 SKAP1Q86WV1 359 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 TMEM173Q86WV6 379 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 GJA10Q969M2 543 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 MAP7D2Q96T17 732 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 ADAM7Q9H2U9 754 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 LIMD1Q9UGP4 676 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 SORCS3Q9UPU3 1222 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 CACNA1HO95180 2353 aa18.24■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 CHMP2AO43633 222 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 CPA1P15085 419 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 EPCAMP16422 314 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 ADD1P35611 737 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 PPM1AP35813 382 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 BCAR1P56945 870 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 ADCK5Q3MIX3 580 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 ZNF746Q6NUN9 644 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 CRYGNQ8WXF5 182 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 LPPQ93052 612 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.23■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 ZC3H11BA0A1B0GUI2 810 aaPredicted RBP18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 ZNF862O60290 1169 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 CYP3A4P08684 503 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 GPC3P51654 580 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 DRP2Q13474 957 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 UGCGQ16739 394 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 RASEFQ8IZ41 740 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 VPS52Q8N1B4 723 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 LINC01465Q8N7H1 131 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 NLRP7Q8WX94 980 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 TBC1D22BQ9NU19 505 aa18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP18.22■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 WDR87Q6ZQQ6 2873 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 TMEM150BA6NC51 233 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 MAGEB2O15479 319 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 ZC3H11AO75152 810 aaKnown RBP eCLIP18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 OATP04181 439 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 TMOD1P28289 359 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 PRKCEQ02156 737 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 TMC5Q6UXY8 1006 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 TMEM87AQ8NBN3 555 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 MFSD1Q9H3U5 465 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 CEP131Q9UPN4 1083 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 INPP5FQ9Y2H2 1132 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 SPTBN4Q9H254 2564 aa18.21■□□□□ 0.51
CS-227ENST00000551441 MEIS3P2A8K0S8 358 aa18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms