RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000551206.5

USP15-217, Transcript of ubiquitin specific peptidase 15, humanhuman

TSL 2

Gene USP15, Length 1,022 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP15-217ENST00000551206 ADGRE1Q14246 886 aa14.58□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 RHPN2Q8IUC4 686 aa14.58□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 KSR1Q8IVT5 923 aa14.58□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 C4orf32Q8N8J7 132 aa14.58□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 LINC01599Q8WXQ3 324 aa14.58□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 SLC7A3Q8WY07 619 aa14.58□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 PPM1EQ8WY54 764 aa14.58□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 TMEM143Q96AN5 459 aa14.58□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 FTHL17Q9BXU8 183 aa14.58□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 GBF1Q92538 1859 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 DENND3A2RUS2 1198 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 LINC01553A4QN01 128 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 EPOPA6NHQ4 379 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 MGEA5O60502 916 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 FGFR4P22455 802 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 GPC3P51654 580 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 CUL4AQ13619 759 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 ODR4Q5SWX8 454 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 FAM228AQ86W67 206 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 MAFAQ8NHW3 353 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 PIGOQ8TEQ8 1089 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 ADAM2Q99965 735 aa14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 WDR81Q562E7 1941 aa14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 A0A087WZ62 844 aa14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 DARSP14868 501 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 RFC5P40937 340 aa14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 CCDC85BQ15834 202 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 CATSPER3Q86XQ3 398 aa14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 ZNF710Q8N1W2 664 aa14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 NEK9Q8TD19 979 aa14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 NLRP4Q96MN2 994 aa14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP14.56□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 MICAL3Q7RTP6 2002 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 MED24O75448 989 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 LYPLA2O95372 231 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 CDC42EP1Q00587 391 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 EMC2Q15006 297 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 RILPL1Q5EBL4 403 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 MICALL1Q8N3F8 863 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 ERMNQ8TAM6 284 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 TGS1Q96RS0 853 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 C17orf80Q9BSJ5 609 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 TUFT1Q9NNX1 390 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 ANKEF1Q9NU02 776 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 LRFN2Q9ULH4 789 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 CHD9Q3L8U1 2897 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 SIP14410 1827 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 COL6A3P12111 3177 aa14.55□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 PTPRSQ13332 1948 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 CDH23Q9H251 3354 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 STAG3L1P0CL83 205 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 ERVK-21P61565 698 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 IL17AQ16552 155 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 SLC24A5Q71RS6 500 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 MAEAQ7L5Y9 396 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 FERMT3Q86UX7 667 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 NPAS4Q8IUM7 802 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 SLC17A8Q8NDX2 589 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 RGS18Q9NS28 235 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 LRWD1Q9UFC0 647 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 PPME1Q9Y570 386 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.54□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 DGKIO75912 1065 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 RPA1P27694 616 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 SARSP49591 514 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 RARRES1P49788 294 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 GATMP50440 423 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 GRB10Q13322 594 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 DSC3Q14574 896 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 DTHD1Q6ZMT9 781 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 CRIPAKQ8N1N5 446 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 FIBCD1Q8N539 461 aa14.53□□□□□ -0.08
USP15-217ENST00000551206 GDPD5Q8WTR4 605 aa14.53□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms