RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP20.47■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 PADI3Q9ULW8 664 aa20.47■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa20.47■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 ARHGEF35A5YM69 484 aa20.46■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 GPR182O15218 404 aa20.46■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 RPS6KA5O75582 802 aa20.46■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 CABP7Q86V35 215 aa20.46■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 LINC00301Q8NCQ3 95 aa20.46■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 NLRP7Q8WX94 980 aa20.46■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 PPP1R16BQ96T49 567 aa20.46■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 DNM3Q9UQ16 869 aa20.46■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 NOC2LQ9Y3T9 749 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM265A0A087WTH1 108 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 USO1O60763 962 aaKnown RBP20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 PPP6R2O75170 966 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 EYA4O95677 639 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 AMHP03971 560 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 GRIN1Q05586 938 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 RAB30Q15771 203 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM119Q4V9L6 283 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 FAM109BQ6ICB4 259 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 FAM228AQ86W67 206 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 RHPN2Q8IUC4 686 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM143Q96AN5 459 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 SCLT1Q96NL6 688 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 CCSER1Q9C0I3 900 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 BHMT2Q9H2M3 363 aa20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP20.45■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 LOC101059915A0A1B0GWI6 518 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 CYP11B2P19099 503 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 MARCKSP29966 332 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 ARL2P36404 184 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 UBA7P41226 1012 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 DEFB103AP81534 67 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 POU5F1BQ06416 359 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 GRB10Q13322 594 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 STK38Q15208 465 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 PADI6Q6TGC4 694 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 HERC6Q8IVU3 1022 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 CALML4Q96GE6 196 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 LRCH3Q96II8 777 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 CDK5RAP3Q96JB5 506 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 PNMA5Q96PV4 448 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 CSRNP2Q9H175 543 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 ZDHHC9Q9Y397 364 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 COL4A6Q14031 1691 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 TTC3P53804 2025 aa20.44■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 A0A087WWV3 80 aa20.43■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 A0A087WZ62 844 aa20.43■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa20.43■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 IFNLR1Q8IU57 520 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 NLRP4Q96MN2 994 aa20.43■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 PBX4Q9BYU1 374 aa20.43■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 IFT122Q9HBG6 1241 aa20.43■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa20.43■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 PCDHA11Q9Y5I1 949 aa20.43■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 E9PMD0 336 aa20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 SPTLC2O15270 562 aa20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 DNAJB2P25686 324 aa20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 TFDP1Q14186 410 aa20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 KCNK18Q7Z418 384 aa20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 LINC01599Q8WXQ3 324 aa20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 NFKBIZQ9BYH8 718 aa20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 TMX1Q9H3N1 280 aa20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 CFAP45Q9UL16 551 aa20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa20.42■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 GRXCR1A8MXD5 290 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 GJB5O95377 273 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 DDIT3P35638 169 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 KSR1Q8IVT5 923 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 MYOCDQ8IZQ8 938 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 RNF149Q8NC42 400 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 KCNG4Q8TDN1 519 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 ASAP3Q8TDY4 903 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 TOP1MTQ969P6 601 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 TIPINQ9BVW5 301 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 C1orf112Q9NSG2 853 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 KCND2Q9NZV8 630 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 MSRAQ9UJ68 235 aa20.41■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 ENPP3O14638 875 aa20.4■□□□□ 0.86
COPS7A-216ENST00000543170 GLRA2P23416 452 aa20.4■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.9 ms