RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000530170.1

RPS3-215, Transcript of ribosomal protein S3, human

TSL 5

Gene RPS3, Length 531 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RPS3-215	ENST00000530170	RDM1	Q8NG50	284 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	SMCR8	Q8TEV9	937 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	ZC3H15	Q8WU90	426 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	ZNF296	Q8WUU4	475 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	KCNN1	Q92952	543 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	HVCN1	Q96D96	273 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PRMT6	Q96LA8	375 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	FIZ1	Q96SL8	496 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	RHOXF2	Q9BQY4	288 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	WDR18	Q9BV38	432 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	RUSC1	Q9BVN2	902 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	BHMT2	Q9H2M3	363 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	TDRD3	Q9H7E2	651 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	ZSWIM4	Q9H7M6	989 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	JADE2	Q9NQC1	790 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	ST7	Q9NRC1	585 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	STIM2	Q9P246	746 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	HDAC6	Q9UBN7	1215 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	ZNF70	Q9UC06	446 aa	Predicted RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PGAP2	Q9UHJ9	254 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	HPCAL4	Q9UM19	191 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170		A0A0G2JMZ2	1700 aa		10.02	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	KIAA1217	Q5T5P2	1943 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	FAM196B	A6NMK8	535 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170		A6NNZ2	444 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	BHMG1	C9JSJ3	638 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	ICAM1	P05362	532 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	CCDC172	P0C7W6	258 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PYGB	P11216	843 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PON1	P27169	355 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PSMC2	P35998	433 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	ZNF76	P36508	570 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	CASP5	P51878	434 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	HADHB	P55084	474 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	IK	Q13123	557 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	RAPGEF1	Q13905	1077 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	RRP1B	Q14684	758 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	DLGAP5	Q15398	846 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	CLUL1	Q15846	466 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	SHROOM1	Q2M3G4	852 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	TUBB8	Q3ZCM7	444 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	MEI1	Q5TIA1	1274 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	XRRA1	Q6P2D8	792 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	IRF2BP2	Q7Z5L9	587 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	SLFN11	Q7Z7L1	901 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	MCF2L2	Q86YR7	1114 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	NELFCD	Q8IXH7	590 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PBK	Q96KB5	322 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	MLXIP	Q9HAP2	919 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	GBA2	Q9HCG7	927 aa	Predicted RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PDE11A	Q9HCR9	933 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	SIX2	Q9NPC8	291 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PCDHAC2	Q9Y5I4	1007 aa		10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	ZNFX1	Q9P2E3	1918 aa	Known RBP	10.01	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	COL11A1	P12107	1806 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	EML1	O00423	815 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	TGFB1I1	O43294	461 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	GAS7	O60861	476 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	AKAP3	O75969	853 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PRPF6	O94906	941 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	SLITRK3	O94933	977 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	GCNT3	O95395	438 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	MOCS3	O95396	460 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	TFRC	P02786	760 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	MYB	P10242	640 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	SCP2	P22307	547 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	CAP2	P40123	477 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	HIRA	P54198	1017 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PSMC6	P62333	389 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	JAG1	P78504	1218 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	GFPT1	Q06210	699 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PPP2R5E	Q16537	467 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	USH1G	Q495M9	461 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	CCDC181	Q5TID7	509 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	SYCE1	Q8N0S2	351 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	OGFOD1	Q8N543	542 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	LRRC57	Q8N9N7	239 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	EEF2KMT	Q96G04	330 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	SPAG5	Q96R06	1193 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	IWS1	Q96ST2	819 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	SH3GL2	Q99962	352 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	SYT11	Q9BT88	431 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	SELENOO	Q9BVL4	669 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	TMEM59L	Q9UK28	342 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	TTC7A	Q9ULT0	858 aa	Predicted RBP	10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	DIS3	Q9Y2L1	958 aa	Known RBP	10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PCDHB13	Q9Y5F0	798 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	DUSP10	Q9Y6W6	482 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	PAPPA2	Q9BXP8	1791 aa		10	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	MYH9	P35579	1960 aa	Known RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170		A0A087X0T9	212 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	NPHP3-ACAD11	A0A0J9YXS1	232 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	9.99	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	CCDC188	H7C350	402 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	IVL	P07476	585 aa		9.99	□□□□□ -0.81
RPS3-215	ENST00000530170	FAM228B	P0C875	321 aa		9.99	□□□□□ -0.81

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