RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000520276.5

TRPS1-211, Transcript of transcriptional repressor GATA binding 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRPS1, Length 4,083 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPS1-211ENST00000520276 KANK3Q6NY19 840 aa10.97□□□□□ -0.65
TRPS1-211ENST00000520276 SH3BP5LQ7L8J4 393 aa10.97□□□□□ -0.65
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TRPS1-211ENST00000520276 KRT12Q99456 494 aa10.97□□□□□ -0.65
TRPS1-211ENST00000520276 ABCF3Q9NUQ8 709 aa10.97□□□□□ -0.65
TRPS1-211ENST00000520276 MYH7P12883 1935 aa10.97□□□□□ -0.65
TRPS1-211ENST00000520276 FAM205CA6NFA0 338 aa10.97□□□□□ -0.65
TRPS1-211ENST00000520276 POTECB2RU33 542 aa10.97□□□□□ -0.65
TRPS1-211ENST00000520276 WDR46O15213 610 aaKnown RBP10.97□□□□□ -0.65
TRPS1-211ENST00000520276 DDAH1O94760 285 aa10.97□□□□□ -0.65
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TRPS1-211ENST00000520276 GALNT15Q8N3T1 639 aa10.97□□□□□ -0.65
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TRPS1-211ENST00000520276 DDX42Q86XP3 938 aaKnown RBP eCLIP10.97□□□□□ -0.65
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TRPS1-211ENST00000520276 LIN7AO14910 233 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
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TRPS1-211ENST00000520276 REM2Q8IYK8 340 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
TRPS1-211ENST00000520276 CCDC197Q8NCU1 140 aa10.96□□□□□ -0.65
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TRPS1-211ENST00000520276 PGAP2Q9UHJ9 254 aa10.96□□□□□ -0.65
TRPS1-211ENST00000520276 STK38LQ9Y2H1 464 aa10.96□□□□□ -0.65
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TRPS1-211ENST00000520276 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP10.96□□□□□ -0.65
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TRPS1-211ENST00000520276 CEP131Q9UPN4 1083 aa10.96□□□□□ -0.65
TRPS1-211ENST00000520276 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP10.96□□□□□ -0.66
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TRPS1-211ENST00000520276 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP10.95□□□□□ -0.66
TRPS1-211ENST00000520276 SYDE2Q5VT97 1194 aa10.95□□□□□ -0.66
TRPS1-211ENST00000520276 DPP9Q86TI2 863 aa10.95□□□□□ -0.66
TRPS1-211ENST00000520276 ENAHQ8N8S7 591 aaPredicted RBP10.95□□□□□ -0.66
TRPS1-211ENST00000520276 FAM81AQ8TBF8 368 aa10.95□□□□□ -0.66
TRPS1-211ENST00000520276 ZNF507Q8TCN5 953 aa10.95□□□□□ -0.66
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TRPS1-211ENST00000520276 CHMP6Q96FZ7 201 aa10.95□□□□□ -0.66
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