RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000519004.5

PABPC1-208, Transcript of poly(A) binding protein cytoplasmic 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PABPC1, Length 2,401 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC1-208ENST00000519004 NR1H4Q96RI1 486 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 PLIN2Q99541 437 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ERP44Q9BS26 406 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CEP72Q9P209 647 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 TIAM2Q8IVF5 1701 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CHD4Q14839 1912 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 GFPT2O94808 682 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 GH1P01241 217 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 WDR72Q3MJ13 1102 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 DAB2IPQ5VWQ8 1189 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ANKRD42Q8N9B4 389 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 TLE6Q9H808 572 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 METTL5Q9NRN9 209 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 STXBP5LQ9Y2K9 1186 aa14.62□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SLIT3O75094 1523 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ABCB11O95342 1321 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 A0A0J9YVX5 310 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 TRAFD1O14545 582 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SULT2A1Q06520 285 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ALX1Q15699 326 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SH2D4BQ5SQS7 431 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 FAM83BQ5T0W9 1011 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 DUS1LQ6P1R4 473 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 C4orf50Q6ZRC1 276 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 OTUD6AQ7L8S5 288 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 TUBGCP5Q96RT8 1024 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CNNM2Q9H8M5 875 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 DDX43Q9NXZ2 648 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 RIPK2O43353 540 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 KRT36O76013 467 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 TRAPPC10P48553 1259 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CDK7P50613 346 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 YARSP54577 528 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 PTENP60484 403 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 AP1B1Q10567 949 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 MPP2Q14168 576 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 DDB1Q16531 1140 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CENPPQ6IPU0 288 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 KIAA0895Q8NCT3 520 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CENPKQ9BS16 269 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 MIS12Q9H081 205 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 STK32BQ9NY57 414 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CEP126Q9P2H0 1117 aa14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ADAMTS3O15072 1205 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 FUT4P22083 530 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 FGFR4P22455 802 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 MARK3P27448 753 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SH3BGRP55822 239 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 DR1Q01658 176 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SLC34A1Q06495 639 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 TPCN2Q8NHX9 752 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 NAT14Q8WUY8 206 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ARHGEF2Q92974 986 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 GRAMD1AQ96CP6 724 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 KRT82Q9NSB4 513 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 GRHL1Q9NZI5 618 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SNX24Q9Y343 169 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 DAAM1Q9Y4D1 1078 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 USH1CQ9Y6N9 552 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 PPP1R2P41236 205 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 GJA8P48165 433 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 PHEXP78562 749 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 HPCAP84074 193 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ZRSR2Q15696 482 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 C1orf141Q5JVX7 400 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ZNF449Q6P9G9 518 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 HPS3Q969F9 1004 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 AGBL1Q96MI9 1066 aa14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 STRBPQ96SI9 672 aaKnown RBP14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 V9GY48 417 aaPredicted RBP14.6□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ZNF532Q9HCE3 1301 aa14.59□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 TBX10O75333 385 aa14.59□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 CBX6O95503 412 aa14.59□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP14.59□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 MCAMP43121 646 aa14.59□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 NEK3P51956 506 aa14.59□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 COBLL1Q53SF7 1204 aa14.59□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.59□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.59□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 SLFN11Q7Z7L1 901 aa14.59□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 ESR2Q92731 530 aa14.59□□□□□ -0.07
PABPC1-208ENST00000519004 GLG1Q92896 1179 aa14.59□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.7 ms