RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513165.1

HOXC-AS3-202, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene HOXC-AS3, Length 533 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM205CA6NFA0 338 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TNFRSF10AO00220 468 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCOR1O75376 2440 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPIRE1Q08AE8 756 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C4orf19Q8IY42 314 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KIF2CQ99661 725 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NSUN3Q9H649 340 aaKnown RBP18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CYP26B1Q9NR63 512 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLAGL2Q9UPG8 496 aa18.87■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM150BA6NC51 233 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCK2O43639 380 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNQ1P51787 676 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DRP2Q13474 957 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 OTUD6AQ7L8S5 288 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NLRP7Q8WX94 980 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SH2D3AQ9BRG2 576 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 UBE2ZQ9H832 354 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SH2B1Q9NRF2 756 aaPredicted RBP18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHA12Q9UN75 941 aa18.86■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GRM6O15303 877 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FAM102BQ5T8I3 360 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF410Q86VK4 478 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SCLT1Q96NL6 688 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CHST12Q9NRB3 414 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 BRWD1Q9NSI6 2320 aa18.85■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HOXA2O43364 376 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RFC5P40937 340 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 COL19A1Q14993 1142 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CALCRLQ16602 461 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LEXMQ3ZCV2 418 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCEAL5Q5H9L2 206 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NCAPH2Q6IBW4 605 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CCDC83Q8IWF9 413 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLC7A3Q8WY07 619 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CEP170P1Q96L14 293 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LXNQ9BS40 222 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 AAASQ9NRG9 546 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DACT1Q9NYF0 836 aa18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP18.84■□□□□ 0.61
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A087WZ62 844 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 A0A0U1RQF3 1178 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TBKBP1A7MCY6 615 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SLITRK3O94933 977 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EOMESO95936 686 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 YWHABP31946 246 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GATMP50440 423 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NPEPPSP55786 919 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PLA2G4FQ68DD2 849 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RHPN2Q8IUC4 686 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KLHL23Q8NBE8 558 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SPPL3Q8TCT6 385 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PABPC5Q96DU9 382 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 DYDC2Q96IM9 177 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 C8orf76Q96K31 380 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MTMR9Q96QG7 549 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 HSD17B14Q9BPX1 270 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TRAIPQ9BWF2 469 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ALG13Q9NP73 1137 aaKnown RBP18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 RGL1Q9NZL6 768 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 PCDHB12Q9Y5F1 795 aa18.83■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 GAS2O43903 313 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEMFO60524 1076 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 LYPLA2O95372 231 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ITGB1P05556 798 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CAMK1Q14012 370 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ECHDC2Q86YB7 292 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TPH2Q8IWU9 490 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FBXO18Q8NFZ0 1043 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 NEK9Q8TD19 979 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TMEM117Q9H0C3 514 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOXP1Q9H334 677 aaPredicted RBP18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MYO7AQ13402 2215 aa18.82■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 MUC3AQ02505 3323 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 ASAP2O43150 1006 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FGFR1P11362 822 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 KCNA5P22460 613 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 TXKP42681 527 aa18.81■□□□□ 0.6
HOXC-AS3-202ENST00000513165 FOSBP53539 338 aa18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 48.4 ms