RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513069.1

SH3BP2-225, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 866 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-225ENST00000513069 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP16.96■□□□□ 0.31
SH3BP2-225ENST00000513069 A0A087WZ62 844 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 TLL1O43897 1013 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 CA3P07451 260 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 HTRA4P83105 476 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 NFX1Q12986 1120 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 DSC3Q14574 896 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 EMC2Q15006 297 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 ARL6IP4Q66PJ3 421 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 SPRED2Q7Z698 418 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 ERMNQ8TAM6 284 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 NACC1Q96RE7 527 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 RAD9AQ99638 391 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 IFT122Q9HBG6 1241 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 CLIC4Q9Y696 253 aa16.95■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 MICAL3Q7RTP6 2002 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 GPR182O15218 404 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 MUTP22033 750 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 FGFR4P22455 802 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 CDC42EP1Q00587 391 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 TAP1Q03518 808 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 PTPAQ15257 358 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 RHPN2Q8IUC4 686 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 EXOC8Q8IYI6 725 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 CDX2Q99626 313 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 FTHL17Q9BXU8 183 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC28A3Q9HAS3 691 aa16.94■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 VWA3AA6NCI4 1184 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 DGAT1O75907 488 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 UPP2O95045 317 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 ARL2P36404 184 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 GRIN1Q05586 938 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 HAUS3Q68CZ6 603 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 KCNK18Q7Z418 384 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF410Q86VK4 478 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 SNX29Q8TEQ0 813 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 NLRP7Q8WX94 980 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 ADAM2Q99965 735 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 ZBED2Q9BTP6 218 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 KIAA1024Q9UPX6 916 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 GBF1Q92538 1859 aa16.93■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 COL6A3P12111 3177 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 GAS2O43903 313 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM189BP81408 668 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 PKP1Q13835 747 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 HYIQ5T013 277 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 PPP2R2DQ66LE6 453 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 FAM43BQ6ZT52 329 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 SP7Q8TDD2 431 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 ASAP3Q8TDY4 903 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 NLRP4Q96MN2 994 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 PNMA5Q96PV4 448 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 MTRQ99707 1265 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 RAB34Q9BZG1 259 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 MINDY3Q9H8M7 445 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 RGS18Q9NS28 235 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 INSL6Q9Y581 213 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa16.92■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 LINC01553A4QN01 128 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 EPOPA6NHQ4 379 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 C9IYK1 514 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 USO1O60763 962 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 BMP15O95972 392 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 KRT79Q5XKE5 535 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 PADI6Q6TGC4 694 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 TCP11Q8WWU5 503 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 SCLT1Q96NL6 688 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 USP28Q96RU2 1077 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 GPRC5CQ9NQ84 441 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 STK24Q9Y6E0 443 aa16.91■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 E9PMD0 336 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 ASAP2O43150 1006 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 DGKIO75912 1065 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 CYP11B2P19099 503 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 GLRA2P23416 452 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 GRB10Q13322 594 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 ODR4Q5SWX8 454 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 SLC24A5Q71RS6 500 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 RNF149Q8NC42 400 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 MYLIPQ8WY64 445 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 BHMT2Q9H2M3 363 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 PRDM12Q9H4Q4 367 aa16.9■□□□□ 0.3
SH3BP2-225ENST00000513069 CERS4Q9HA82 394 aa16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28 ms