RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502686.6

CTCFL-211, Transcript of CCCTC-binding factor like, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTCFL, Length 2,023 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTCFL-211ENST00000502686 MFSD10Q14728 455 aa14.49□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 KIAA0753Q2KHM9 967 aa14.49□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 UVSSAQ2YD98 709 aa14.49□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP14.49□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 NELFCDQ8IXH7 590 aa14.49□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 PPP1R13LQ8WUF5 828 aa14.49□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 P2RX5Q93086 422 aa14.49□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 MYH11P35749 1972 aa14.49□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 K7ENM7 598 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 PSEN2P49810 448 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 PURAQ00577 322 aaKnown RBP14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 DRP2Q13474 957 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 ZNF720Q7Z2F6 126 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 LRRC71Q8N4P6 559 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 SEMA6BQ9H3T3 888 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 SUGCTQ9HAC7 445 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 HMX1Q9NP08 348 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 NFE2L3Q9Y4A8 694 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 COL1A2P08123 1366 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 HAS3O00219 553 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 C22orf31O95567 290 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 CCNE1P24864 410 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 ARL2P36404 184 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 RTP1P59025 263 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 DMP1Q13316 513 aaPredicted RBP14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 GRIK4Q16099 956 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 ASAP3Q8TDY4 903 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 KIFC3Q9BVG8 833 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 C17orf75Q9HAS0 396 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 FANCLQ9NW38 375 aa14.48□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 CCDC169A6NNP5 214 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 SLC16A4O15374 487 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 ZEB2O60315 1214 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 KPNA6O60684 536 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 KIF20AO95235 890 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 SMIM10L2AP0DMW4 78 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 SMIM10L2BP0DMW5 78 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 MAPTP10636 758 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 HSPA8P11142 646 aaKnown RBP14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 GLRA2P23416 452 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 KLRC1P26715 233 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 HOXD13P35453 343 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 NPTX2P47972 431 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 SPATA1Q5VX52 437 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 ANKRD40Q6AI12 368 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 CENPPQ6IPU0 288 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 TTI2Q6NXR4 508 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 KSR1Q8IVT5 923 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 EXOC8Q8IYI6 725 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 KLHDC9Q8NEP7 349 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 ZNF507Q8TCN5 953 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 IFT74Q96LB3 600 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 HSD3B7Q9H2F3 369 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 SETD4Q9NVD3 440 aa14.47□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 BICDL2A1A5D9 508 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 GAS2O43903 313 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 SMTNP53814 917 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 NCKAP1LP55160 1127 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 KCNA1Q09470 495 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 BMT2Q1RMZ1 405 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 EFCAB12Q6NXP0 572 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 CXCL17Q6UXB2 119 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 METTL13Q8N6R0 699 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 SPIRE2Q8WWL2 714 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 MTG1Q9BT17 334 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 KATNAL1Q9BW62 490 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 STRA6Q9BX79 667 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 KCTD10Q9H3F6 313 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 KMT5AQ9NQR1 393 aa14.46□□□□□ -0.09
CTCFL-211ENST00000502686 MAGEB2O15479 319 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 PPP1R37O75864 691 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 CST5P28325 142 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 CLCN3P51790 818 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 TPM4P67936 248 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 HSP90AA4PQ58FG1 418 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 MARCH8Q5T0T0 291 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 IER5Q5VY09 327 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 MTHFD1LQ6UB35 978 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 LMBR1Q8WVP7 490 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 TCP11Q8WWU5 503 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 SAMSN1Q9NSI8 373 aaKnown RBP14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa14.46□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 RRN3P2A6NIE6 340 aa14.45□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 MSCO60682 206 aa14.45□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 UBE4BO95155 1302 aa14.45□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 PLCB2Q00722 1185 aa14.45□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 KCNA10Q16322 511 aa14.45□□□□□ -0.1
CTCFL-211ENST00000502686 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP14.45□□□□□ -0.1
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.6 ms