RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000502260.5

SH3BP2-205, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 727 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-205ENST00000502260 ZMYND12Q9H0C1 365 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ADAMTS10Q9H324 1103 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 CEP131Q9UPN4 1083 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa15.64■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 NID2Q14112 1375 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ESYT2A0FGR8 921 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 HOXA2O43364 376 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 SRGAP2BP0DMP2 458 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 PDIA3P30101 505 aaKnown RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 PBX3P40426 434 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 EVCP57679 992 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 TOB2Q14106 344 aaPredicted RBP15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 EFCAB12Q6NXP0 572 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 LLGL2Q6P1M3 1020 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ECHDC2Q86YB7 292 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 LRRC43Q8N309 656 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF558Q96NG5 402 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 APOL5Q9BWW9 433 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 PDRG1Q9NUG6 133 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 KAT6AQ92794 2004 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF318Q5VUA4 2279 aa15.63■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 HOXB8P17481 243 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 CIITAP33076 1130 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 VCPP55072 806 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 CCT2P78371 535 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 PTPN21Q16825 1174 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 PRR16Q569H4 304 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 MCTP2Q6DN12 878 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 LRRC71Q8N4P6 559 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 LENG9Q96B70 501 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 MAP7D2Q96T17 732 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 C6orf50Q9HD87 102 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 AKT3Q9Y243 479 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 WDFY4Q6ZS81 3184 aa15.62■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 PRPF3O43395 683 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 EDIL3O43854 480 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF862O60290 1169 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 TMOD1P28289 359 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 AVPR2P30518 371 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 PPM1AP35813 382 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ANAPC15P60006 121 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 KRT17Q04695 432 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 CLLU1OSQ5K130 101 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 TMC7Q7Z402 723 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ABI1Q8IZP0 508 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 REXO1Q8N1G1 1221 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF710Q8N1W2 664 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 FAM167AQ96KS9 214 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 SPG21Q9NZD8 308 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 CDH22Q9UJ99 828 aa15.61■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 WDR64B1ANS9 1081 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 OATP04181 439 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 DARSP14868 501 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 IFNAR1P17181 557 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 GNA11P29992 359 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 GPC3P51654 580 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 NTRK3Q16288 839 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC39A11Q8N1S5 342 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 MRPL43Q8N983 215 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 CASP10Q92851 521 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 PHKBQ93100 1093 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 RNF26Q9BY78 433 aaPredicted RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 NRBP2Q9NSY0 501 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 SAMM50Q9Y512 469 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 HCFC2Q9Y5Z7 792 aa15.6■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 A0A0U1RQF3 1178 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 C2orf71A6NGG8 1288 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 EOMESO95936 686 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 FGFR4P22455 802 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 SP100P23497 879 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 RNF169Q8NCN4 708 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 RIPOR3Q96MK2 946 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 SLC26A6Q9BXS9 759 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 ADAM7Q9H2U9 754 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 DISC1Q9NRI5 854 aa15.59■□□□□ 0.09
SH3BP2-205ENST00000502260 CPLX1O14810 134 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-205ENST00000502260 MSH4O15457 936 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-205ENST00000502260 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-205ENST00000502260 PDGFBP01127 241 aaPredicted RBP15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-205ENST00000502260 PRKCEQ02156 737 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-205ENST00000502260 STK3Q13188 491 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-205ENST00000502260 UGCGQ16739 394 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-205ENST00000502260 TPRNQ4KMQ1 711 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-205ENST00000502260 ZBTB33Q86T24 672 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-205ENST00000502260 TRIM22Q8IYM9 498 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-205ENST00000502260 HELQQ8TDG4 1101 aa15.58■□□□□ 0.08
SH3BP2-205ENST00000502260 POMKQ9H5K3 350 aa15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms