RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498648.5

STRADB-210, Transcript of STE20-related kinase adaptor beta, humanhuman

TSL 3

Gene STRADB, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRADB-210ENST00000498648 LIX1LQ8IVB5 337 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 Q8N1Y9 231 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SDR16C5Q8N3Y7 309 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PLBD2Q8NHP8 589 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TSPEARQ8WU66 669 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TCTN2Q96GX1 697 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PTCHD1Q96NR3 888 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 NT5C1BQ96P26 610 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PTPN18Q99952 460 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 COLEC11Q9BWP8 271 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 SMYD2Q9NRG4 433 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 KCNH7Q9NS40 1196 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 IFT80Q9P2H3 777 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 TMX2Q9Y320 296 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa5.72□□□□□ -1.49
STRADB-210ENST00000498648 PRSS38A1L453 326 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 C7orf72A4D263 438 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 DGAT1O75907 488 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 RPN1P04843 607 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 RAB6AP20340 208 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 SDHAP31040 664 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 MAP2K6P52564 334 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 DAG1Q14118 895 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 TMEM132BQ14DG7 1078 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 SEC23AQ15436 765 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 GPATCH4Q5T3I0 446 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 AGAP9Q5VTM2 703 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 SPATA1Q5VX52 437 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 FDX2Q6P4F2 183 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 LMBR1LQ6UX01 489 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 BRINP3Q76B58 766 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 NME9Q86XW9 330 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 MAML3Q96JK9 1138 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 ZSCAN31Q96LW9 406 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 CENPOQ9BU64 300 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 UNKQ9C0B0 810 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 MAGEH1Q9H213 219 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 KCTD10Q9H3F6 313 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 PNPLA8Q9NP80 782 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 UBN1Q9NPG3 1134 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 GGA3Q9NZ52 723 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 DAGLAQ9Y4D2 1042 aa5.71□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 B4E171 279 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 APOL1O14791 398 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 IRAK2O43187 625 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 TMCC2O75069 709 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 IL18RAPO95256 599 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 PAPLNO95428 1278 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 BCRP11274 1271 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 HARSP12081 509 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 ELF1P32519 619 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 TSPAN7P41732 249 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 WASP42768 502 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 ALDH9A1P49189 494 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 LAPTM5Q13571 262 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 SLC35G1Q2M3R5 365 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 ZACNQ401N2 412 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 PKDCCQ504Y2 493 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 CATSPEREQ5SY80 951 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 SFRP5Q5T4F7 317 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 ARMC3Q5W041 872 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 EP400NLQ6ZTU2 488 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 CHSY3Q70JA7 882 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 FASTKD5Q7L8L6 764 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 ZC3HAV1Q7Z2W4 902 aaKnown RBP5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 FBXO11Q86XK2 927 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 TMTC1Q8IUR5 882 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 PHYKPLQ8IUZ5 450 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 NLGN4XQ8N0W4 816 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 OXR1Q8N573 874 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 CCDC33Q8N5R6 958 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 TOP6BLQ8N6T0 577 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 C7orf31Q8N865 590 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 NRG4Q8WWG1 115 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 ANKS1AQ92625 1134 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 DPF3Q92784 378 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 FERMT2Q96AC1 680 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 RGMAQ96B86 450 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 ACE2Q9BYF1 805 aaPredicted RBP5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 GPR62Q9BZJ7 368 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 SEMA6CQ9H3T2 930 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 CNTD2Q9H8S5 307 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 WASH6PQ9NQA3 447 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 VPS45Q9NRW7 570 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 DPP7Q9UHL4 492 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 TMPRSS11EQ9UL52 423 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 TTLL3Q9Y4R7 772 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 ATP23Q9Y6H3 246 aa5.7□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 PHGDHO43175 533 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 PLA2G6O60733 806 aa5.69□□□□□ -1.5
STRADB-210ENST00000498648 GFPT2O94808 682 aa5.69□□□□□ -1.5
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 66.8 ms