RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000498054.1

POLR1B-215, Transcript of RNA polymerase I subunit B, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1B, Length 636 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1B-215ENST00000498054 SLC2A13Q96QE2 648 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 GORASP1Q9BQQ3 440 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 SLC13A1Q9BZW2 595 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ZFP69BQ9UJL9 534 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 IRS2Q9Y4H2 1338 aa5.67□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MAFGO15525 162 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHGA12O60330 932 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 IL33O95760 270 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PF4V1P10720 104 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 BCAR1P56945 870 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CCT2P78371 535 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CDK17Q00537 523 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ODF1Q14990 250 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 WDR72Q3MJ13 1102 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PITRM1Q5JRX3 1037 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CCDC181Q5TID7 509 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 DTX3Q8N9I9 347 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 RAX2Q96IS3 184 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 NOX5Q96PH1 765 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 BTBD2Q9BX70 525 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 RTFDC1Q9BY42 306 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CDH19Q9H159 772 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 OR10A5Q9H207 317 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 KCTD10Q9H3F6 313 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MTG2Q9H4K7 406 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PCDH18Q9HCL0 1135 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 DPP7Q9UHL4 492 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ANKRD6Q9Y2G4 727 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHGA9Q9Y5G4 932 aaKnown RBP5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHGA8Q9Y5G5 932 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHGA7Q9Y5G6 932 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHGA6Q9Y5G7 932 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHGA3Q9Y5H0 932 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 GPR45Q9Y5Y3 372 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MYPNQ86TC9 1320 aa5.66□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 TRIM75PA6NK02 468 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 FZD9O00144 591 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 N4BP3O15049 544 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 SEMA7AO75326 666 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MTHFD2P13995 350 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ATF3P18847 181 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 THBS2P35442 1172 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ADCY8P40145 1251 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 ITGA1P56199 1179 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 DLG4P78352 724 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 PPARAQ07869 468 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 LCE4AQ5TA78 99 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 SPOCD1Q6ZMY3 1216 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 IGDCC3Q8IVU1 814 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MYO1HQ8N1T3 1032 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CPA6Q8N4T0 437 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 AUTS2Q8WXX7 1259 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 JADE3Q92613 823 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 FTSJ1Q9UET6 329 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa5.65□□□□□ -1.5
POLR1B-215ENST00000498054 CLASP1Q7Z460 1538 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 ABLIM3O94929 683 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 IL18BPO95998 194 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 XPAP23025 273 aaPredicted RBP5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 IL13RA1P78552 427 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 CD83Q01151 205 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 NFATC3Q12968 1075 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 ADAM9Q13443 819 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 TCIRG1Q13488 830 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 MOGSQ13724 837 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 OTOP2Q7RTS6 562 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 C14orf80Q86SX3 495 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 TPH2Q8IWU9 490 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 TTLL6Q8N841 843 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 KYQ8NBH2 561 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 HSPBAP1Q96EW2 488 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 TEKT5Q96M29 485 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 LRGUKQ96M69 825 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 WRNIP1Q96S55 665 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 WNT8AQ9H1J5 351 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 PRDM12Q9H4Q4 367 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 GIT1Q9Y2X7 761 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 IRAK3Q9Y616 596 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 NUMBLQ9Y6R0 609 aa5.64□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 CYP7B1O75881 506 aa5.63□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 PFKMP08237 780 aa5.63□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 IGFBP6P24592 240 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 SLC5A3P53794 718 aa5.63□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 MRPS9P82933 396 aaKnown RBP5.63□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 HTRA3P83110 453 aa5.63□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 MAP3K12Q12852 859 aa5.63□□□□□ -1.51
POLR1B-215ENST00000498054 SPIDRQ14159 915 aa5.63□□□□□ -1.51
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.5 ms