RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495588.2

GAPVD1-218, Transcript of GTPase activating protein and VPS9 domains 1, humanhuman

TSL 5

Gene GAPVD1, Length 274 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1-218ENST00000495588 PHACTR4Q8IZ21 702 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 KIF2CQ99661 725 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ADAM7Q9H2U9 754 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 LUC7LQ9NQ29 371 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ST7Q9NRC1 585 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 CD2APQ9Y5K6 639 aa6.66□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 DUOX1Q9NRD9 1551 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 DDAH1O94760 285 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC5A1P13866 664 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF143P52747 638 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 UBE4AQ14139 1066 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 TTC22Q5TAA0 569 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 CNKSR3Q6P9H4 555 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 VHLLQ6RSH7 139 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 FRMD5Q7Z6J6 570 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 PPFIBP1Q86W92 1011 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 TTLL6Q8N841 843 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 SYT8Q8NBV8 401 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 NLGN2Q8NFZ4 835 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 LPIN2Q92539 896 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC6A18Q96N87 628 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ANKRD2Q9GZV1 360 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 EPN3Q9H201 632 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 ECHDC1Q9NTX5 307 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 STAP2Q9UGK3 403 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 POLLQ9UGP5 575 aa6.65□□□□□ -1.34
GAPVD1-218ENST00000495588 XDHP47989 1333 aa6.65□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 AOX1Q06278 1338 aa6.65□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 TTC41PQ6P2S7 1318 aa6.65□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 IRS2Q9Y4H2 1338 aa6.65□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 SNED1Q8TER0 1413 aa6.65□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 B2RBV5 119 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 ENPP3O14638 875 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 UFL1O94874 794 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 IFIT1P09914 478 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 INSRRP14616 1297 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 PHKA1P46020 1223 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 GYG1P46976 350 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 KCNJ4P48050 445 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC7A5Q01650 507 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 TEKQ02763 1124 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 ANKRD39Q53RE8 183 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 SDE2Q6IQ49 451 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 NLRX1Q86UT6 975 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 LINC01599Q8WXQ3 324 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 GPATCH3Q96I76 525 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 BDH2Q9BUT1 245 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 BOLA2Q9H3K6 86 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 EBF1Q9UH73 591 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF804BA4D1E1 1349 aa6.64□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 ERC2O15083 957 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 CLEC3AO75596 197 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 ATP5JP18859 108 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 VIPR1P32241 457 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 GBP1P32455 592 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 MCAMP43121 646 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 CCDC158Q5M9N0 1113 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 TTC39AQ5SRH9 613 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 GORABQ5T7V8 394 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 DPP8Q6V1X1 898 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 EEPD1Q7L9B9 569 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 TBC1D16Q8TBP0 767 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 FAM84BQ96KN1 310 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 DNAJC7Q99615 494 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 CNTD2Q9H8S5 307 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 EPB41L4AQ9HCS5 686 aaPredicted RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 CRTAC1Q9NQ79 661 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 PCDHB10Q9UN67 800 aa6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 AK9Q5TCS8 1911 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 AKAP11Q9UKA4 1901 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 MED23Q9ULK4 1368 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 C9IYK1 514 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 SUSD5O60279 629 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 SDSP20132 328 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 IFRD2Q12894 506 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 SLC14A2Q15849 920 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 GNPTABQ3T906 1256 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 CCDC93Q567U6 631 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 BMP2KLQ5H9B9 411 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 NBPF12Q5TAG4 269 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 KIAA1211LQ6NV74 962 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 LILRB2Q8N423 598 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 MZB1Q8WU39 189 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 RNF141Q8WVD5 230 aa6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 EDC3Q96F86 508 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
GAPVD1-218ENST00000495588 HAUS7Q99871 368 aa6.62□□□□□ -1.35
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