RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000495354.1

ARF4-208, Transcript of ADP ribosylation factor 4, human

TSL 3

Gene ARF4, Length 495 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ARF4-208	ENST00000495354	CLCN3	P51790	818 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	JAK3	P52333	1124 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	NLRP11	P59045	1033 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	ITIH3	Q06033	890 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	COL9A3	Q14050	684 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	PRR16	Q569H4	304 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	CES5A	Q6NT32	575 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	EFCAB12	Q6NXP0	572 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	TMC7	Q7Z402	723 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	PRSS33	Q8NF86	280 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	TCEANC2	Q96MN5	208 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	SPG21	Q9NZD8	308 aa		13.75	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	EVPL	Q92817	2033 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	NID2	Q14112	1375 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	EOMES	O95936	686 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	ATP4A	P20648	1035 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	CDC27	P30260	824 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	KCNC3	Q14003	757 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	GIT2	Q14161	759 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	TRMT1L	Q7Z2T5	733 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	ECHDC2	Q86YB7	292 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	VN1R2	Q8NFZ6	395 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	TMEM169	Q96HH4	297 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	CASD1	Q96PB1	797 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	C22orf23	Q9BZE7	217 aa		13.74	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	GAS7	O60861	476 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	SKI	P12755	728 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	ALDH7A1	P49419	539 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	GPC3	P51654	580 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	PRKCE	Q02156	737 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	APOBR	Q0VD83	1088 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	MTMR3	Q13615	1198 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	LLGL2	Q6P1M3	1020 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	UBALD2	Q8IYN6	164 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	LINC01465	Q8N7H1	131 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	RDM1	Q8NG50	284 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	NLRP7	Q8WX94	980 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	RIPOR3	Q96MK2	946 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	RIT2	Q99578	217 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	TEKT3	Q9BXF9	490 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	RNF26	Q9BY78	433 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	S1PR5	Q9H228	398 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	CHST12	Q9NRB3	414 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	DISC1	Q9NRI5	854 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	FAM217B	Q9NTX9	383 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	DZANK1	Q9NVP4	752 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	HCST	Q9UBK5	93 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	STK39	Q9UEW8	545 aa		13.73	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354		A0A0U1RQF3	1178 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	ST18	O60284	1047 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	CDC45	O75419	566 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	DARS	P14868	501 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	CA8	P35219	290 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	MTHFR	P42898	656 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	ADCK5	Q3MIX3	580 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	SYCE2	Q6PIF2	218 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	SLC39A11	Q8N1S5	342 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	LRRC71	Q8N4P6	559 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	RNF169	Q8NCN4	708 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	ASIC4	Q96FT7	647 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	GCOM2	Q9BZD3	368 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	INO80B	Q9C086	356 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	ADAMTS10	Q9H324	1103 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	SORCS3	Q9UPU3	1222 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	HCFC2	Q9Y5Z7	792 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	KMT2E	Q8IZD2	1858 aa		13.72	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	HIDE1	A8MVS5	230 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	DNM2	P50570	870 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	RAB27A	P51159	221 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	USP11	P51784	963 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	IRX6	P78412	446 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	RBM10	P98175	930 aa	Known RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	LRCH2	Q5VUJ6	765 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	BLOC1S2	Q6QNY1	142 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	JPH2	Q9BR39	696 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	ADAM7	Q9H2U9	754 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	RNF19A	Q9NV58	838 aa		13.71	□□□□□ -0.21
ARF4-208	ENST00000495354	C2orf71	A6NGG8	1288 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	CHMP2A	O43633	222 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	AVPR2	P30518	371 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	POLG	P54098	1239 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	TCF15	Q12870	199 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	CLLU1OS	Q5K130	101 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	IER5L	Q5T953	404 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	LRRC55	Q6ZSA7	311 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354		Q6ZUG5	572 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	ZNF410	Q86VK4	478 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	RASEF	Q8IZ41	740 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	FBXL16	Q8N461	479 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	MRPL43	Q8N983	215 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	TDRD5	Q8NAT2	981 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	HELQ	Q8TDG4	1101 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	BRF1	Q92994	677 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	LENG9	Q96B70	501 aa		13.7	□□□□□ -0.22
ARF4-208	ENST00000495354	CCDC136	Q96JN2	1154 aa		13.7	□□□□□ -0.22

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