RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000494398.5

CERKL-213, Transcript of ceramide kinase like, humanhuman

TSL 2

Gene CERKL, Length 2,391 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CERKL-213ENST00000494398 COL20A1Q9P218 1284 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 ZNRF3Q9ULT6 936 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 NENFQ9UMX5 172 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 ZNF536O15090 1300 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 NFIBO00712 420 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 TRIM49P0CI25 452 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 TRIM49CP0CI26 452 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 BCRP11274 1271 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 PRPF38AQ8NAV1 312 aaKnown RBP23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 IFT81Q8WYA0 676 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 CAVIN3Q969G5 261 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 HOOK2Q96ED9 719 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 PBKQ96KB5 322 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 INTUQ9ULD6 942 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 SAMM50Q9Y512 469 aa23.25■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 P4HBP07237 508 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 TNNC1P63316 161 aa23.24■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 NIM1KQ8IY84 436 aa23.24■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 CPXCR1Q8N123 301 aa23.24■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 DAW1Q8N136 415 aa23.24■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 K7ENM7 598 aa23.23■■□□□ 1.31
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CERKL-213ENST00000494398 MAPK7Q13164 816 aa23.23■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 PTPROQ16827 1216 aa23.23■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 NBPF9Q3BBW0 867 aa23.23■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 MCF2L2Q86YR7 1114 aa23.23■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP23.23■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 ATP8B3O60423 1300 aa23.23■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 A0A0A6YYK5 440 aaPredicted RBP23.23■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.23■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 PEX26Q7Z412 305 aa23.23■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 STRA6Q9BX79 667 aa23.23■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 NFU1Q9UMS0 254 aa23.23■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 ESYT3A0FGR9 886 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 WNT10BO00744 389 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 CEP104O60308 925 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 LMNB1P20700 586 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 MYL7Q01449 175 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 BFSP1Q12934 665 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 PAK2Q13177 524 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 SLC9A9Q8IVB4 645 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 IL31RAQ8NI17 732 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 CWC15Q9P013 229 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 PGAP2Q9UHJ9 254 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 RPTORQ8N122 1335 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 GOLGA6CA6NDK9 693 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 ZSCAN5CA6NGD5 496 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 PPP1R37O75864 691 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 CCDC172P0C7W6 258 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 GOLGA6DP0CG33 693 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 MAP3K10Q02779 954 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 NNTQ13423 1086 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 ALS2CLQ60I27 953 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 GLYCTKQ8IVS8 523 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 KLHL7Q8IXQ5 586 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 CLEC4DQ8WXI8 215 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 RUFY1Q96T51 708 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 GOLGA6AQ9NYA3 693 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 APEX2Q9UBZ4 518 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 ZHX2Q9Y6X8 837 aa23.22■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 DHX15O43143 795 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 HSF2BPO75031 334 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 ALAS1P13196 640 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 GALCP54803 685 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 PPP1R3FQ6ZSY5 799 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 FMNL3Q8IVF7 1028 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 SYCE1Q8N0S2 351 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 SLC30A5Q8TAD4 765 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 FAM76AQ8TAV0 307 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 LNX1Q8TBB1 728 aaPredicted RBP23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 TMEM59LQ9UK28 342 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 OPA1O60313 960 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 KRT13P13646 458 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 DPEP1P16444 411 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 MYBPC2Q14324 1141 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 TKFCQ3LXA3 575 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 NIPA1Q7RTP0 329 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 DAAM2Q86T65 1068 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 ACTRT1Q8TDG2 376 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 TMEM206Q9H813 350 aa23.21■■□□□ 1.31
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CERKL-213ENST00000494398 HOMER2Q9NSB8 354 aa23.21■■□□□ 1.31
CERKL-213ENST00000494398 COL4A5P29400 1685 aa23.2■■□□□ 1.3
CERKL-213ENST00000494398 CAMKK2Q96RR4 588 aa23.2■■□□□ 1.3
CERKL-213ENST00000494398 PSME4Q14997 1843 aa23.2■■□□□ 1.3
CERKL-213ENST00000494398 KIF13BQ9NQT8 1826 aa23.2■■□□□ 1.3
CERKL-213ENST00000494398 WDR46O15213 610 aaKnown RBP23.2■■□□□ 1.3
CERKL-213ENST00000494398 RAD51CO43502 376 aa23.2■■□□□ 1.3
CERKL-213ENST00000494398 NPEPPSP55786 919 aa23.2■■□□□ 1.3
CERKL-213ENST00000494398 CXCL9Q07325 125 aa23.2■■□□□ 1.3
CERKL-213ENST00000494398 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
CERKL-213ENST00000494398 MTMR1Q13613 665 aa23.2■■□□□ 1.3
CERKL-213ENST00000494398 PCNX4Q63HM2 1172 aa23.2■■□□□ 1.3
CERKL-213ENST00000494398 SLFN11Q7Z7L1 901 aa23.2■■□□□ 1.3
CERKL-213ENST00000494398 METTL13Q8N6R0 699 aa23.2■■□□□ 1.3
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