RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492954.1

PTPRU-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRU, Length 625 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-207ENST00000492954 DARSP14868 501 aaKnown RBP20.21■□□□□ 0.83
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PTPRU-207ENST00000492954 SPIRE1Q08AE8 756 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 EPHA7Q15375 998 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 FAM102BQ5T8I3 360 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 SLFN12Q8IYM2 578 aa20.21■□□□□ 0.83
PTPRU-207ENST00000492954 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP20.21■□□□□ 0.83
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PTPRU-207ENST00000492954 CYP26B1Q9NR63 512 aa20.21■□□□□ 0.83
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PTPRU-207ENST00000492954 CEP170P1Q96L14 293 aa20.19■□□□□ 0.82
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PTPRU-207ENST00000492954 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP20.18■□□□□ 0.82
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PTPRU-207ENST00000492954 TPH2Q8IWU9 490 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRU-207ENST00000492954 NLRP4Q96MN2 994 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRU-207ENST00000492954 MTMR9Q96QG7 549 aa20.16■□□□□ 0.82
PTPRU-207ENST00000492954 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP20.16■□□□□ 0.82
PTPRU-207ENST00000492954 TMEM60Q9H2L4 133 aa20.16■□□□□ 0.82
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PTPRU-207ENST00000492954 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
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PTPRU-207ENST00000492954 XKR9Q5GH70 373 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-207ENST00000492954 OTUD6AQ7L8S5 288 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-207ENST00000492954 FAM184AQ8NB25 1140 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-207ENST00000492954 RNF169Q8NCN4 708 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-207ENST00000492954 SPPL3Q8TCT6 385 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-207ENST00000492954 TMEM143Q96AN5 459 aa20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-207ENST00000492954 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP20.15■□□□□ 0.82
PTPRU-207ENST00000492954 PPME1Q9Y570 386 aa20.15■□□□□ 0.82
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