RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489343.5

NPHP3-AS1-201, NPHP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NPHP3-AS1, Length 2,957 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HIP1RO75146 1068 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NR3C1P04150 777 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PTPRAP18433 802 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBB4BP68371 445 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C1orf186Q6ZWK4 172 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EEPD1Q7L9B9 569 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PICK1Q9NRD5 415 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa16.94■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 VWA5AO00534 786 aa16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TGFB1I1O43294 461 aa16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNI2Q6ZMN8 369 aaPredicted RBP16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MICALL1Q8N3F8 863 aa16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IFT81Q8WYA0 676 aa16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ANO9A1A5B4 782 aa16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF35A5YM69 484 aa16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 WDR46O15213 610 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PALMO75781 387 aa16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYF2O95926 243 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARHGEF16Q5VV41 709 aa16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TRIM59Q8IWR1 403 aa16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM178BQ8IXR5 827 aa16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM71BQ8TC56 605 aa16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RBM12Q9NTZ6 932 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA8IPA6NC78 632 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA8JA6NMD2 632 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CTNND1O60716 968 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PAFAH1B1P43034 410 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MNAT1P51948 309 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL30Q0D2K2 578 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA0753Q2KHM9 967 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HGSNATQ68CP4 663 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DAW1Q8N136 415 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 NOX5Q96PH1 765 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DONSONQ9NYP3 566 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HYOU1Q9Y4L1 999 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 A0A087X0T9 212 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FRMD3A2A2Y4 597 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FZD9O00144 591 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FAM228BP0C875 321 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLRC1P26715 233 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BACE1P56817 501 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PGM5Q15124 567 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PADI6Q6TGC4 694 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIAA1683Q9H0B3 1180 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DHX15O43143 795 aaKnown RBP16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCNE2O96020 404 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SYCP3Q8IZU3 236 aa16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZMYM2Q9UBW7 1377 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HSD17B4P51659 736 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IQCEQ6IPM2 695 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZNF280CQ8ND82 737 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPM1EQ8WY54 764 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SPAG5Q96R06 1193 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TLR10Q9BXR5 811 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PARVGQ9HBI0 331 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMCO5BA8MYB1 307 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 K7ENM7 598 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CDK17Q00537 523 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SEMA3FQ13275 785 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP2R5CQ13362 524 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TMEM132BQ14DG7 1078 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TREML2Q5T2D2 321 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCTP2Q6DN12 878 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 C8orf74Q6P047 294 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SGIP1Q9BQI5 828 aa16.91■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GOLGA6BA6NDN3 693 aa16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 BACH1O14867 736 aa16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CNTN2Q02246 1040 aa16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AFAP1L1Q8TED9 768 aa16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KIF13BQ9NQT8 1826 aa16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 TUBBP07437 444 aa16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 DLG4P78352 724 aa16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MAP3K10Q02779 954 aa16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SCYL3Q8IZE3 742 aa16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 AGO4Q9HCK5 861 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 SLC16A4O15374 487 aa16.89■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 ZBED4O75132 1171 aa16.89■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 MCM3P25205 808 aa16.89■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 GUCY2FP51841 1108 aa16.89■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PPP2R5AQ15172 486 aa16.89■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 COBLL1Q53SF7 1204 aa16.89■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 EPM2AIP1Q7L775 607 aaPredicted RBP16.89■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 KLHL7Q8IXQ5 586 aa16.89■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CLMNQ96JQ2 1002 aa16.89■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 FIZ1Q96SL8 496 aa16.89■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 PDCD2LQ9BRP1 358 aa16.89■□□□□ 0.3
NPHP3-AS1-201ENST00000489343 CEP72Q9P209 647 aa16.89■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.5 ms