RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489247.1

ATG4A-208, Transcript of autophagy related 4A cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4A, Length 623 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4A-208ENST00000489247 PPP1R11O60927 126 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 SMC2O95347 1197 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 CTSHP09668 335 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 GCFC2P16383 781 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 ZNF18P17022 549 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 CYP3A7P24462 503 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 ADCY7P51828 1080 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 CACNB3P54284 484 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 MYL5Q02045 173 aa6.25□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 TRAF1Q13077 416 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 AP3B2Q13367 1082 aa6.25□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 GRM2Q14416 872 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 SEPT2Q15019 361 aa6.25□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 ZRSR1Q15695 479 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 C9orf131Q5VYM1 1079 aa6.25□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 CNNM4Q6P4Q7 775 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 DTHD1Q6ZMT9 781 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 CLEC10AQ8IUN9 316 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 IGSF22Q8N9C0 903 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 ENOX1Q8TC92 643 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 BSNDQ8WZ55 320 aa6.25□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 PAGE5Q96GU1 130 aa6.25□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 FRMD6Q96NE9 622 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 BCO2Q9BYV7 579 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 DEFB129Q9H1M3 183 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 TAOK3Q9H2K8 898 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 TMEM60Q9H2L4 133 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 C12orf49Q9H741 205 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 TMX2Q9Y320 296 aa6.25□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 A0A096LPE4 126 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 A0A1W2PPZ6 126 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 VWA3AA6NCI4 1184 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 BECN2A8MW95 431 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 F5H6K3 240 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 H3BRJ5 948 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 FZD9O00144 591 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 FOXN1O15353 648 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 DYRK3O43781 588 aa6.24□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 RAD17O75943 681 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 WISP1O95388 367 aa6.24□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 OR52Z1P0C646 297 aa6.24□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 TPM4P67936 248 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 JAG1P78504 1218 aa6.24□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 KLRC3Q07444 240 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 TCP10Q12799 353 aa6.24□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 CUL4BQ13620 913 aa6.24□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 KCNB1Q14721 858 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 INF2Q27J81 1249 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 COBLL1Q53SF7 1204 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 NAALADL2Q58DX5 795 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 SPECC1Q5M775 1068 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 TTBK2Q6IQ55 1244 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 AOPEPQ8N6M6 819 aa6.24□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 TBCKQ8TEA7 893 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 SLC7A3Q8WY07 619 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 CUL5Q93034 780 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 SMARCE1Q969G3 411 aa6.24□□□□□ -1.41
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ATG4A-208ENST00000489247 DISC1Q9NRI5 854 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 KCND1Q9NSA2 647 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 SPTLC3Q9NUV7 552 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 KBTBD4Q9NVX7 518 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 IMPACTQ9P2X3 320 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 ZBTB21Q9ULJ3 1066 aa6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 FRMPD2Q68DX3 1309 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 A0A1W2PRG0 241 aa6.23□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 WNT10BO00744 389 aa6.23□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP6.23□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 PAX4O43316 350 aa6.23□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 ADAM11O75078 769 aa6.23□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 ALX3O95076 343 aa6.23□□□□□ -1.41
ATG4A-208ENST00000489247 ZBTB7AO95365 584 aa6.23□□□□□ -1.41
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