RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484135.1

PTPRC-211, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRC, Length 612 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRC-211ENST00000484135 TUSC3Q13454 348 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 TRMT10BQ6PF06 316 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 KCNH5Q8NCM2 988 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC113Q9H0I3 377 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 TMEM168Q9H0V1 697 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 IPPKQ9H8X2 491 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 DSEQ9UL01 958 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 USP19O94966 1318 aa6.22□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 KIAA0232Q92628 1395 aa6.21□□□□□ -1.41
PTPRC-211ENST00000484135 FAM83GA6ND36 823 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CCER2I3L3R5 266 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 AQP7O14520 342 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 NKRFO15226 690 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 INSRRP14616 1297 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 HOXC9P31274 260 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 IL13P35225 146 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PUM1Q14671 1186 aaKnown RBP eCLIP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF827Q17R98 1081 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 MAMDC2Q7Z304 686 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ARHGEF25Q86VW2 580 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SCUBE1Q8IWY4 988 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CLEC4DQ8WXI8 215 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PRDM11Q9NQV5 511 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 DLL4Q9NR61 685 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 FTSJ1Q9UET6 329 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 INVSQ9Y283 1065 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PEAK1Q9H792 1746 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ZNF536O15090 1300 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 LTN1O94822 1766 aa6.21□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 NFAT5O94916 1531 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 AATKQ6ZMQ8 1374 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 C9orf118A6NHY6 69 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ADCY3O60266 1144 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PLATP00750 562 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 HMOX1P09601 288 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 FAHP16930 419 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 MLLT6P55198 1093 aaPredicted RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 EFEMP1Q12805 493 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 FAM209AQ5JX71 171 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PHF19Q5T6S3 580 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 KCTD1Q719H9 257 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PLEKHH3Q7Z736 793 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CCDC146Q8IYE0 955 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ZCCHC14Q8WYQ9 949 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 IP6K1Q92551 441 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PTPRN2Q92932 1015 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CFAP53Q96M91 514 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 GPR20Q99678 358 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CNOT11Q9UKZ1 510 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 WASF3Q9UPY6 502 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 RGPD5Q99666 1765 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SLIT3O75094 1523 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 JCADQ9P266 1359 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO21O94952 628 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ZBTB38Q8NAP3 1195 aaPredicted RBP6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 FBXO41Q8TF61 875 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 DEPDC7Q96QD5 511 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CD244Q9BZW8 370 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 HSPBP1Q9NZL4 362 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 USP54Q70EL1 1684 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 KDM2BQ8NHM5 1336 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ABCA3Q99758 1704 aa6.19□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ITGB3P05106 788 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 EVA1CP58658 441 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PAK1Q13153 545 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 RASA3Q14644 834 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 HABP4Q5JVS0 413 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 FOXB2Q5VYV0 432 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 PROSER1Q86XN7 944 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 DTX3Q8N9I9 347 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ARMC5Q96C12 935 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 MYRFQ9Y2G1 1151 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 TELO2Q9Y4R8 837 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 RGPD2P0DJD1 1756 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 FLT4P35916 1363 aa6.18□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ENO2P09104 434 aaPredicted RBP6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 FAM153BP0C7A2 387 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 NAT1P18440 290 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 GLRBP48167 497 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 GABREP78334 506 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 ST5P78524 1137 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 GUCY1A3Q02108 690 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SURF1Q15526 300 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SKIDA1Q1XH10 827 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 CD276Q5ZPR3 534 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRC-211ENST00000484135 SULT6B1Q6IMI4 303 aa6.17□□□□□ -1.42
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