RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000484061.5

TTC7A-209, Transcript of tetratricopeptide repeat domain 7A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TTC7A, Length 3,085 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC7A-209ENST00000484061 ATP6V1G3Q96LB4 118 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 STK33Q9BYT3 514 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 FRMPD4Q14CM0 1322 aa16.01■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 CCDC188H7C350 402 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 KRIT1O00522 736 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 ZNF131P52739 623 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 CBWD6Q4V339 395 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 CBWD3Q5JTY5 395 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 CBWD5Q5RIA9 395 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 ZNF720Q7Z2F6 126 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 FBXO41Q8TF61 875 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 GPR88Q9GZN0 384 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 NEUROG2Q9H2A3 272 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 MMP10P09238 476 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 ITGA4P13612 1032 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 PRELPP51888 382 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 DRAP1Q14919 205 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 GLYCTKQ8IVS8 523 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 EFCAB13Q8IY85 973 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 SYT11Q9BT88 431 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 OSGEPQ9NPF4 335 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 DNAJC12Q9UKB3 198 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 UBE4BO95155 1302 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 NR1D1P20393 614 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 HSD17B3P37058 310 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 CSRNP1Q96S65 589 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 AGPAT3Q9NRZ7 376 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 DMAC2Q9NW81 257 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 SEL1LQ9UBV2 794 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 NCANO14594 1321 aa16■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 LMNB1P20700 586 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 UBXN2AP68543 259 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 UAP1Q16222 522 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 CEP85LQ5SZL2 805 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 LRIG3Q6UXM1 1119 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 MAATS1Q7Z4T9 603 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 COL2A1P02458 1487 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 HMGB1P1B2RPK0 211 aaPredicted RBP15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 FAM178BQ8IXR5 827 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 SLC35G2Q8TBE7 412 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 PPM1EQ8WY54 764 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 FAM107BQ9H098 131 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 TMBIM4Q9HC24 238 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 AMACRQ9UHK6 382 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 FAM169AQ9Y6X4 670 aa15.99■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 UTRNP46939 3433 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 H0YGN5 161 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 BUB1BO60566 1050 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 GAS7O60861 476 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 TMEM253P0C7T8 217 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 POLR2MP0CAP2 368 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 CYP2J2P51589 502 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 GUCY1A3Q02108 690 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 HS2ST1Q7LGA3 356 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 AMFRQ9UKV5 643 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 NFS1Q9Y697 457 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 IGSF9BQ9UPX0 1349 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 TRIM49P0CI25 452 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 TRIM49CP0CI26 452 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 MUTP22033 750 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 ITGB3BPQ13352 177 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 CCDC174Q6PII3 467 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 TEX2Q8IWB9 1127 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 ACER1Q8TDN7 264 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 RFFLQ8WZ73 363 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 NACC1Q96RE7 527 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 ODF2LQ9ULJ1 636 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 SAMM50Q9Y512 469 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 LSP1P33241 339 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 PPATQ06203 517 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 TRAF1Q13077 416 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 PPP2R5AQ15172 486 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 KCTD19Q17RG1 926 aaPredicted RBP15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 ODR4Q5SWX8 454 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 LRRC45Q96CN5 670 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 UNC45AQ9H3U1 944 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 APEX2Q9UBZ4 518 aa15.98■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 A0A087WUV0 522 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 NDUFAB1O14561 156 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 ZEB2O60315 1214 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 CEP55Q53EZ4 464 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 STXBP4Q6ZWJ1 553 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 PACS2Q86VP3 889 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 AKT1S1Q96B36 256 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 XPO5Q9HAV4 1204 aaKnown RBP eCLIP15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 KCND2Q9NZV8 630 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP15.97■□□□□ 0.15
TTC7A-209ENST00000484061 DDX3YO15523 660 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.5 ms