RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482278.5

TUBGCP2-208, Transcript of tubulin gamma complex associated protein 2, human

TSL 2

Gene TUBGCP2, Length 3,553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CEP72	Q9P209	647 aa		12.85	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EYA4	O95677	639 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NR3C1	P04150	777 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ITGB5	P18084	799 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CEP55	Q53EZ4	464 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RPUSD2	Q8IZ73	545 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GOLPH3	Q9H4A6	298 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ARMCX3	Q9UH62	379 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RAB21	Q9UL25	225 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CCPG1	Q9ULG6	757 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PHF20L1	A8MW92	1017 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TGFB1I1	O43294	461 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM76A	Q8TAV0	307 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HDAC7	Q8WUI4	952 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZBED3	Q96IU2	234 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MS4A14	Q96JA4	679 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GAN	Q9H2C0	597 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TMEM165	Q9HC07	324 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TBC1D12	O60347	775 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	USO1	O60763	962 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FKBP1C	Q5VVH2	108 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MICALL2	Q8IY33	904 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RDH13	Q8NBN7	331 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	HOOK2	Q96ED9	719 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	POLR3C	Q9BUI4	534 aa	Predicted RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RAVER2	Q9HCJ3	691 aa	Known RBP	12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BAIAP2L1	Q9UHR4	511 aa		12.84	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZMYM2	Q9UBW7	1377 aa		12.83	□□□□□ -0.35
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TISP43	B9A030	160 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ATP8B1	O43520	1251 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FAM13A	O94988	1023 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MYBL2	P10244	700 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RNASE9	P60153	205 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	BRD3	Q15059	726 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	C1orf186	Q6ZWK4	172 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CREG2	Q8IUH2	290 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MTMR14	Q8NCE2	650 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC5A5	Q92911	643 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MRPL11	Q9Y3B7	192 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF536	O15090	1300 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CHUK	O15111	745 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LCA5L	O95447	670 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FTCD	O95954	541 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ALAS1	P13196	640 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GMPS	P49915	693 aa	Predicted RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EDRF1	Q3B7T1	1238 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC9C1	Q4G0N8	1177 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	DPY19L2P1	Q6NXN4	242 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZNF662	Q6ZS27	426 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	RBM46	Q8TBY0	533 aa	Known RBP	12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	WNK4	Q96J92	1243 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TEPSIN	Q96N21	525 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SNX12	Q9UMY4	172 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRAF3IP3	Q9Y228	551 aa		12.83	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GOLGA6C	A6NDK9	693 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IPO5	O00410	1097 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TACC1	O75410	805 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GOLGA6D	P0CG33	693 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KLRC1	P26715	233 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	CYP2J2	P51589	502 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PRELP	P51888	382 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MARS	P56192	900 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SLC7A5	Q01650	507 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KLHL30	Q0D2K2	578 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TUBB2A	Q13885	445 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	NBPF12	Q5TAG4	269 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	KCTD16	Q68DU8	428 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	EHBP1	Q8NDI1	1231 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LXN	Q9BS40	222 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TUBB2B	Q9BVA1	445 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GOLGA6A	Q9NYA3	693 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PSD3	Q9NYI0	1048 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FEM1B	Q9UK73	627 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GOLGA6L7	A0A1B0GV03	622 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LRRIQ3	A6PVS8	624 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	XRCC5	P13010	732 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PON1	P27169	355 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	USP14	P54578	494 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	PTK2	Q05397	1052 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	USP4	Q13107	963 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	ZC3H3	Q8IXZ2	948 aa	Known RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	12.82	□□□□□ -0.36	3e-7	■■■■■ 153.1
TUBGCP2-208	ENST00000482278	L1RE1	Q9UN81	338 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GNA14	O95837	355 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SERPING1	P05155	500 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TGFB2	P61812	414 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	IFT88	Q13099	833 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	MTMR2	Q13614	643 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GNPTAB	Q3T906	1256 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SPDYE1	Q8NFV5	336 aa	Predicted RBP	12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	GBP3	Q9H0R5	595 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		12.82	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	LRRN2	O75325	713 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	FLOT1	O75955	427 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	AFP	P02771	609 aa	Known RBP	12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRIM49	P0CI25	452 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	TRIM49C	P0CI26	452 aa		12.81	□□□□□ -0.36
TUBGCP2-208	ENST00000482278	UCHL3	P15374	230 aa		12.81	□□□□□ -0.36

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