RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000481081.1

CASQ1-203, Transcript of calsequestrin 1, humanhuman

TSL 2

Gene CASQ1, Length 869 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1-203ENST00000481081 PIGSQ96S52 555 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 FOXQ1Q9C009 403 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 RNF41Q9H4P4 317 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ARHGEF3Q9NR81 526 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SMG5Q9UPR3 1016 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 PCDHGA2Q9Y5H1 932 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 MIA3Q5JRA6 1907 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SALL3Q9BXA9 1300 aa8.29□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 IGF2RP11717 2491 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 MEIS2O14770 477 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 HOXA2O43364 376 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 GPR32O75388 356 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ITGB5P18084 799 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 RFX1P22670 979 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 PMLP29590 882 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 METAP2P50579 478 aaKnown RBP eCLIP8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 CLCN4P51793 760 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 BCAR1P56945 870 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 GIT2Q14161 759 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ODR4Q5SWX8 454 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ECHDC2Q86YB7 292 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 CMASQ8NFW8 434 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 MYADMQ96S97 322 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 DDX23Q9BUQ8 820 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 VN1R3Q9BXE9 311 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 RHOBTB2Q9BYZ6 727 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 WDR6Q9NNW5 1121 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 SLC2A4RGQ9NR83 387 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 ZSWIM5Q9P217 1185 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 USP18Q9UMW8 372 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 GINS2Q9Y248 185 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 LAMA4Q16363 1823 aa8.28□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 COL4A3Q01955 1670 aa8.27□□□□□ -1.08
CASQ1-203ENST00000481081 LAMA5O15230 3695 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 B4E1Z4 1266 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ANHXE9PGG2 379 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 LILRB3O75022 631 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 PAPLNO95428 1278 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 KLRC1P26715 233 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CA8P35219 290 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CRYBB1P53674 252 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SHC2P98077 582 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 TRAF1Q13077 416 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 BMS1Q14692 1282 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SEC23AQ15436 765 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 PTPN14Q15678 1187 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 DCLRE1AQ6PJP8 1040 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 USP17L6PQ6QN14 398 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 PLPPR4Q7Z2D5 763 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 DDX53Q86TM3 631 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 PPFIBP1Q86W92 1011 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 HOMER1Q86YM7 354 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 NETO1Q8TDF5 533 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ATRIPQ8WXE1 791 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SECISBP2LQ93073 1101 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 TMEM169Q96HH4 297 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CCDC136Q96JN2 1154 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CDHR1Q96JP9 859 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 KLHL5Q96PQ7 755 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 OSMRQ99650 979 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ZSCAN32Q9NX65 697 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ANGPTL2Q9UKU9 493 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 MTF2Q9Y483 593 aaPredicted RBP8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 UBIAD1Q9Y5Z9 338 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 NBEAQ8NFP9 2946 aa8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 PIK3CDO00329 1044 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 LAMTOR5O43504 91 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 TBC1D4O60343 1298 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ATG7O95352 703 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ALDH7A1P49419 539 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 STAT5BP51692 787 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CSTF1Q05048 431 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 KIZQ2M2Z5 673 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ABI1Q8IZP0 508 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 HELQQ8TDG4 1101 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 EVI5LQ96CN4 794 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 IGSF21Q96ID5 467 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 AZI2Q9H6S1 392 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 SPATA6Q9NWH7 488 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 DYNC1LI1Q9Y6G9 523 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 CLUHO75153 1309 aa8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 DOCK6Q96HP0 2047 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 A0A0U1RQF3 1178 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 KANSL1LA0AUZ9 987 aa8.25□□□□□ -1.09
CASQ1-203ENST00000481081 ZNF213O14771 459 aa8.25□□□□□ -1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 69 ms