RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000480788.1

LNPK-209, Transcript of lunapark, ER junction formation factor, human

TSL 3

Gene LNPK, Length 311 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
LNPK-209	ENST00000480788	DDX46	Q7L014	1031 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	C7orf31	Q8N865	590 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	NEU4	Q8WWR8	484 aa	Predicted RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	USP7	Q93009	1102 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	AJUBA	Q96IF1	538 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	TUBGCP5	Q96RT8	1024 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	WDR26	Q9H7D7	661 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	THG1L	Q9NWX6	298 aa	Known RBP	4.96	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	PRKAB1	Q9Y478	270 aa		4.96	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788		A0A0G2JNJ9	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	RASSF10	A6NK89	507 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	FOXS1	O43638	330 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	MPIG6B	O95866	241 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	ATP2A2	P16615	1042 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	SLC9A1	P19634	815 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	ADCY8	P40145	1251 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	ETV4	P43268	484 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	SLC6A3	Q01959	620 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	DSG1	Q02413	1049 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	SLFN12L	Q6IEE8	588 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	DNAJC10	Q8IXB1	793 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	NXPE1	Q8N323	547 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	GIMAP8	Q8ND71	665 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	CHAC2	Q8WUX2	184 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	EXTL1	Q92935	676 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	ZNF503	Q96F45	646 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	MAML3	Q96JK9	1138 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	ELF4	Q99607	663 aa	Predicted RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	KATNBL1	Q9H079	304 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	CAAP1	Q9H8G2	361 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788		Q9UFV3	132 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	SYNPO2	Q9UMS6	1093 aa		4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	ZFR2	Q9UPR6	939 aa	Known RBP	4.95	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	ZNF891	A8MT65	544 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	GSG1L2	A8MUP6	293 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	NARS	O43776	548 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	RAB11FIP3	O75154	756 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	MAF	O75444	373 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	LSS	P48449	732 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	KCNQ1	P51787	676 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	BCAR1	P56945	870 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	SESN2	P58004	480 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	CD83	Q01151	205 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	PTH1R	Q03431	593 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	LRRC32	Q14392	662 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	PCBP1	Q15365	356 aa	Known RBP eCLIP	4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	DHCR24	Q15392	516 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	LSM12	Q3MHD2	195 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	TCTN3	Q6NUS6	607 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	RTN4RL1	Q86UN2	441 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	SMC1B	Q8NDV3	1235 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	CHTF18	Q8WVB6	975 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	C16orf92	Q96LL3	132 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	GPR101	Q96P66	508 aa	Predicted RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	TTC1	Q99614	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	AMN	Q9BXJ7	453 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	ZDHHC5	Q9C0B5	715 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	MTFR1L	Q9H019	292 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	USP36	Q9P275	1121 aa	Known RBP	4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	TNFRSF18	Q9Y5U5	241 aa		4.94	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788		A0A087X1B8	175 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	DVL2	O14641	736 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	PRL	P01236	227 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	CSF2RB	P32927	897 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	LSP1	P33241	339 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	MCM7	P33993	719 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	DPT	Q07507	201 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	MOGS	Q13724	837 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	GPR158	Q5T848	1215 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	KANK2	Q63ZY3	851 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	GPR155	Q7Z3F1	870 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	FOXRED1	Q96CU9	486 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	LMF1	Q96S06	567 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	KCMF1	Q9P0J7	381 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	SAE1	Q9UBE0	346 aa	Predicted RBP	4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	KCNG1	Q9UIX4	513 aa		4.93	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788		A0A087X0B3	334 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	ZEB2	O60315	1214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	PPFIA2	O75334	1257 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	APOL3	O95236	402 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	FKBP9	O95302	570 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	CNOT4	O95628	575 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	CNGA1	P29973	690 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	STAT3	P40763	770 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	RRAD	P55042	308 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	ADCY2	Q08462	1091 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	EIF4H	Q15056	248 aa	Known RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	DGKD	Q16760	1214 aa		4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	RNF187	Q5TA31	235 aa	Predicted RBP	4.92	□□□□□ -1.62
LNPK-209	ENST00000480788	TMEM200B	Q69YZ2	307 aa		4.92	□□□□□ -1.62

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