RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471526.1

SHQ1-206, Transcript of SHQ1, H/ACA ribonucleoprotein assembly factor, humanhuman

TSL 4

Gene SHQ1, Length 553 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHQ1-206ENST00000471526 LOXHD1Q8IVV2 1947 aa21.7■■□□□ 1.07
SHQ1-206ENST00000471526 PSMD10O75832 226 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 DEXIO95424 95 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 TDP2O95551 362 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 LAG3P18627 525 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 FGFR4P22455 802 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 GPC3P51654 580 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 RBM10P98175 930 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 Q4G0T1 1027 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 ECHDC2Q86YB7 292 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 RNF135Q8IUD6 432 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 ABI1Q8IZP0 508 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 BLIDQ8IZY5 108 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF710Q8N1W2 664 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 NLRP7Q8WX94 980 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 CASD1Q96PB1 797 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 MUTYHQ9UIF7 546 aa21.7■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 HOXA2O43364 376 aa21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 DARSP14868 501 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 COASYQ13057 564 aa21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 MTERF2Q49AM1 385 aa21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 LRRC55Q6ZSA7 311 aa21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 SMRP1Q8NCR6 262 aa21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 AIFM3Q96NN9 605 aa21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 SH2D3AQ9BRG2 576 aa21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 RNF19AQ9NV58 838 aa21.69■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP21.69■■□□□ 1.06
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SHQ1-206ENST00000471526 TMEM150BA6NC51 233 aa21.68■■□□□ 1.06
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SHQ1-206ENST00000471526 DRP2Q13474 957 aa21.68■■□□□ 1.06
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SHQ1-206ENST00000471526 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 RDM1Q8NG50 284 aa21.68■■□□□ 1.06
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SHQ1-206ENST00000471526 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa21.67■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 CYP3A7P24462 503 aa21.67■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 PBX3P40426 434 aa21.67■■□□□ 1.06
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SHQ1-206ENST00000471526 DUSP6Q16828 381 aa21.67■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 XKR3Q5GH77 459 aa21.67■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 KCNT2Q6UVM3 1135 aa21.67■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 ZNF558Q96NG5 402 aa21.67■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 TCF25Q9BQ70 676 aa21.67■■□□□ 1.06
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SHQ1-206ENST00000471526 KIAA1671Q9BY89 1806 aa21.66■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.66■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 M0R2N6 131 aa21.66■■□□□ 1.06
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SHQ1-206ENST00000471526 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 TM6SF1Q9BZW5 370 aa21.66■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 PDRG1Q9NUG6 133 aa21.66■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 KCNJ14Q9UNX9 436 aa21.66■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 LZTS1Q9Y250 596 aa21.66■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 A0A0U1RQF3 1178 aa21.65■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 STBD1O95210 358 aa21.65■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 HOXD11P31277 338 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 DNM2P50570 870 aa21.65■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 KRT17Q04695 432 aa21.65■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
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SHQ1-206ENST00000471526 INF2Q27J81 1249 aa21.65■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 CLLU1OSQ5K130 101 aa21.65■■□□□ 1.06
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SHQ1-206ENST00000471526 B3GNT9Q6UX72 402 aa21.65■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 DAGLBQ8NCG7 672 aa21.65■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 HELQQ8TDG4 1101 aa21.65■■□□□ 1.06
SHQ1-206ENST00000471526 SPG21Q9NZD8 308 aa21.65■■□□□ 1.06
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SHQ1-206ENST00000471526 A0A087WZ62 844 aa21.64■■□□□ 1.05
SHQ1-206ENST00000471526 EOMESO95936 686 aa21.64■■□□□ 1.05
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SHQ1-206ENST00000471526 LLGL2Q6P1M3 1020 aa21.64■■□□□ 1.05
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SHQ1-206ENST00000471526 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.64■■□□□ 1.05
SHQ1-206ENST00000471526 RPGRIP1Q96KN7 1286 aa21.64■■□□□ 1.05
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SHQ1-206ENST00000471526 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SHQ1-206ENST00000471526 DACT1Q9NYF0 836 aa21.64■■□□□ 1.05
SHQ1-206ENST00000471526 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP21.64■■□□□ 1.05
SHQ1-206ENST00000471526 MYH9P35579 1960 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SHQ1-206ENST00000471526 FNDC1Q4ZHG4 1894 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SHQ1-206ENST00000471526 FSD2A1L4K1 749 aa21.63■■□□□ 1.05
SHQ1-206ENST00000471526 HIDE1A8MVS5 230 aa21.63■■□□□ 1.05
SHQ1-206ENST00000471526 LOC730098B7Z3J9 87 aa21.63■■□□□ 1.05
SHQ1-206ENST00000471526 PPM1AP35813 382 aa21.63■■□□□ 1.05
SHQ1-206ENST00000471526 TECP42680 631 aa21.63■■□□□ 1.05
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