RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TTC7AQ9ULT0 858 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa9.29□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 UTRNP46939 3433 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 IGLV3-22A0A075B6J6 115 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 A0A087X0T9 212 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FAM86B1E9PN63 330 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PDE2AO00408 941 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MEIS1O00470 390 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 RAD21O60216 631 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TLR2O60603 784 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GAS7O60861 476 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 RNF40O75150 1001 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PALMO75781 387 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SLITRK3O94933 977 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 LYPLA2O95372 231 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GCNT3O95395 438 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SYF2O95926 243 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GH2P01242 217 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FAM86B2P0C5J1 330 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FAM228BP0C875 321 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 HSPA6P17066 643 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GBP1P32455 592 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 HNRNPH2P55795 449 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MAP3K10Q02779 954 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PABPC4Q13310 644 aaKnown RBP eCLIP9.28□□□□□ -0.921e-323■■□□□ 13.6
ACTB-208ENST00000464611 XRRA1Q6P2D8 792 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 POTEEQ6S8J3 1075 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ZNF720Q7Z2F6 126 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SLFN11Q7Z7L1 901 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CROCCP2Q86T23 111 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP37Q86T82 979 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 LDHDQ86WU2 507 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ZFPM1Q8IX07 1006 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 C12orf56Q8IXR9 622 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FAM186BQ8IYM0 893 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MYCT1Q8N699 235 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CCDC26Q8TAB7 109 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SLC35C1Q96A29 364 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 LRRC45Q96CN5 670 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 EEF2KMTQ96G04 330 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ZBED3Q96IU2 234 aaPredicted RBP9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 LRRC1Q9BTT6 524 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 TEKT3Q9BXF9 490 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 BHMT2Q9H2M3 363 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 SLITRK6Q9H5Y7 841 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 VCPKMTQ9H867 229 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 MLXIPQ9HAP2 919 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 RRAGCQ9HB90 399 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ST7Q9NRC1 585 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 DMAC2Q9NW81 257 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 GGA3Q9NZ52 723 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 NAGPAQ9UK23 515 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 USP20Q9Y2K6 914 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FAN1Q9Y2M0 1017 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 FRMPD4Q14CM0 1322 aa9.28□□□□□ -0.92
ACTB-208ENST00000464611 CLRN2A0PK11 232 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ZNF185O15231 689 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PPFIA4O75335 1185 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ERLIN2O94905 339 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PRPF6O94906 941 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ASNSP08243 561 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TMEM253P0C7T8 217 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 KRT13P13646 458 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 HADHBP55084 474 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 JAM2P57087 298 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 MTMR3Q13615 1198 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RASA3Q14644 834 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CFAP58Q5T655 872 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 LRIG3Q6UXM1 1119 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 INTS8Q75QN2 995 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 CLEC10AQ8IUN9 316 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SULF1Q8IWU6 871 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 FAM178BQ8IXR5 827 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 EFCAB13Q8IY85 973 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 ARFGAP2Q8N6H7 521 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 FAM133AQ8N9E0 248 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 USP38Q8NB14 1042 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 RDM1Q8NG50 284 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 LPAR1Q92633 364 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 HVCN1Q96D96 273 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 BORCS6Q96GS4 357 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 PRMT6Q96LA8 375 aaPredicted RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 SH3GL2Q99962 352 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 TDRD3Q9H7E2 651 aaKnown RBP9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 FAM204AQ9H8W3 233 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 VEZTQ9HBM0 779 aa9.27□□□□□ -0.93
ACTB-208ENST00000464611 NMRK2Q9NPI5 230 aa9.27□□□□□ -0.93
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