RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460160.5

HOXB3-202, Transcript of homeobox B3, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene HOXB3, Length 1,525 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3-202ENST00000460160 CYP4A11Q02928 519 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 DSC3Q14574 896 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 C1orf112Q9NSG2 853 aa26.52■■□□□ 1.84
HOXB3-202ENST00000460160 C9IYK1 514 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 H3BNC9 293 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 MCM7P33993 719 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 TXKP42681 527 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 DNM2P50570 870 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 SLC24A5Q71RS6 500 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 IL27Q8NEV9 243 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 NLRP7Q8WX94 980 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 SCLT1Q96NL6 688 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa26.51■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 SLITRK3O94933 977 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 YWHABP31946 246 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 TMX3Q96JJ7 454 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 CEP170P1Q96L14 293 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 HSD17B14Q9BPX1 270 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 SUCLA2Q9P2R7 463 aaPredicted RBP26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 LRFN2Q9ULH4 789 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 ATG2AQ2TAZ0 1938 aa26.5■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 ZBTB39O15060 712 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 CTNNB1P35222 781 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 GATMP50440 423 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 CDC42EP1Q00587 391 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 GPM6BQ13491 265 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 SKIV2LQ15477 1246 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 NOSTRINQ8IVI9 506 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 TPH2Q8IWU9 490 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 PPME1Q9Y570 386 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 C5orf67F2Z3F1 127 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 BMPR1AP36894 532 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 FAM189BP81408 668 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 SLC7A3Q8WY07 619 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 RWDD3Q9Y3V2 267 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP26.49■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 FGFR4P22455 802 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 RHPN2Q8IUC4 686 aa26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP26.48■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 A0A087WZ62 844 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 POTEMA6NI47 508 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 LYPLA2O95372 231 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 RFC5P40937 340 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF174Q15697 407 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 OTUD6AQ7L8S5 288 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 ZNF410Q86VK4 478 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 KSR1Q8IVT5 923 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 NEK9Q8TD19 979 aa26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP26.47■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 RB1P06400 928 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP26.46■■□□□ 1.832e-6■□□□□ 10.7
HOXB3-202ENST00000460160 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 XKR9Q5GH70 373 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 TJAP1Q5JTD0 557 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 EXOC8Q8IYI6 725 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM161AQ9NX61 479 aa26.46■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 TRAPPC10P48553 1259 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 TTC38Q5R3I4 469 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 FAM102BQ5T8I3 360 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 ASB2Q96Q27 587 aa26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP26.45■■□□□ 1.83
HOXB3-202ENST00000460160 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 TFF2Q03403 129 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 EMC2Q15006 297 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 PTPROQ16827 1216 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 TMEM143Q96AN5 459 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 NLRP4Q96MN2 994 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 OR52Z1P0C646 297 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 PLVAPQ9BX97 442 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 IFT122Q9HBG6 1241 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 KIF3AQ9Y496 699 aa26.44■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 TCF20Q9UGU0 1960 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 GAS2O43903 313 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 FGFR1P11362 822 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 MCM2P49736 904 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 NBR1Q14596 966 aa26.43■■□□□ 1.82
HOXB3-202ENST00000460160 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
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