RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459159.1

SNORD54-201, Transcript of small nucleolar RNA, C/D box 54, humanhuman

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Gene SNORD54, Length 67 nt, Biotype snoRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNORD54-201ENST00000459159 EGLN3Q9H6Z9 239 aa-1.58□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PRR34Q9NV39 138 aa-1.58□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 NXF1Q9UBU9 619 aaKnown RBP-1.58□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ZRANB1Q9UGI0 708 aa-1.58□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 DNMT3LQ9UJW3 386 aa-1.58□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CA5BQ9Y2D0 317 aa-1.58□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa-1.58□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa-1.58□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa-1.58□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP-1.58□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 STRCP1A6NGW2 1772 aa-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 EXPH5Q8NEV8 1989 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 SHANK3Q9BYB0 1731 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CCDC187A0A096LP49 1063 aa-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 TSC22D2O75157 780 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 LY6G6CO95867 125 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 MYCP01106 439 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 MATN1P21941 496 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 L1CAMP32004 1257 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 INPP5BP32019 993 aa-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 AVPR1BP47901 424 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 SLURP1P55000 103 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 LGALS4P56470 323 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 FOXI1Q12951 378 aa-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CBX2Q14781 532 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PCBP2Q15366 365 aaKnown RBP eCLIP-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 NBPF1Q3BBV0 1214 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 KLHL22Q53GT1 634 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PERM1Q5SV97 790 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ZC2HC1BQ5TFG8 222 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 VWA5B1Q5TIE3 1220 aa-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 KRT40Q6A162 431 aa-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 ZNF774Q6NX45 483 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 MSANTD1Q6ZTZ1 278 aa-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 ZNF645Q8N7E2 425 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 LINC01465Q8N7H1 131 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 ZDHHC22Q8N966 263 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 JMYQ8N9B5 988 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 TP53I13Q8NBR0 393 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 AGBL5Q8NDL9 886 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PSD4Q8NDX1 1056 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 NUP133Q8WUM0 1156 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 NUDT8Q8WV74 236 aa-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 LINC00476Q8WZB0 136 aa-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 TNFRSF14Q92956 283 aa-1.59□□□□□ -2.66
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SNORD54-201ENST00000459159 WNT8BQ93098 351 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CHFRQ96EP1 664 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CRAMP1Q96RY5 1269 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 KIR2DL4Q99706 377 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CTRCQ99895 268 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 RNF5Q99942 180 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 C19orf24Q9BVV8 132 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 KLF16Q9BXK1 252 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 RSPO3Q9BXY4 272 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 IL21RQ9HBE5 538 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 PALMDQ9NP74 551 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 DDX4Q9NQI0 724 aaKnown RBP-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 FSCN3Q9NQT6 498 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 RTEL1Q9NZ71 1219 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 CORINQ9Y5Q5 1042 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 USP3Q9Y6I4 520 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 MGAMO43451 1857 aa-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP-1.59□□□□□ -2.66
SNORD54-201ENST00000459159 SHROOM3Q8TF72 1996 aa-1.59□□□□□ -2.66
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