RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442563.5

RABGEF1-204, Transcript of RAB guanine nucleotide exchange factor 1, humanhuman

TSL 4

Gene RABGEF1, Length 553 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1-204ENST00000442563 ZSCAN22P10073 491 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
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RABGEF1-204ENST00000442563 MXD4Q14582 209 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
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RABGEF1-204ENST00000442563 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP18.77■□□□□ 0.6
RABGEF1-204ENST00000442563 FAM228AQ86W67 206 aa18.77■□□□□ 0.6
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RABGEF1-204ENST00000442563 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa18.77■□□□□ 0.6
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RABGEF1-204ENST00000442563 ZNF396Q96N95 335 aaPredicted RBP18.75■□□□□ 0.59
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RABGEF1-204ENST00000442563 PCBP1Q15365 356 aaKnown RBP eCLIP18.72■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 RNF149Q8NC42 400 aa18.72■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 LINC00301Q8NCQ3 95 aa18.72■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 ADAM2Q99965 735 aa18.72■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 NFKBIZQ9BYH8 718 aa18.72■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 MICAL3Q7RTP6 2002 aa18.72■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 DENND3A2RUS2 1198 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 C9IYK1 514 aa18.71■□□□□ 0.59
RABGEF1-204ENST00000442563 MGEA5O60502 916 aa18.71■□□□□ 0.59
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