RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000432105.5

PUM2-208, Transcript of pumilio RNA binding family member 2, human

TSL 5

Gene PUM2, Length 584 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM2-208	ENST00000432105	CLIP3	Q96DZ5	547 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	HSPBAP1	Q96EW2	488 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	NUP88	Q99567	741 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	MYOT	Q9UBF9	498 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	MSRA	Q9UJ68	235 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	PCDHB4	Q9Y5E5	795 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	RPRD2	Q5VT52	1461 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	NHSL1	Q5SYE7	1610 aa		6.06	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	PRAMEF25	A6NGN4	478 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	DVL2	O14641	736 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	PTPN1	P18031	435 aa	Known RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	PTX3	P26022	381 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	RHBDL3	P58872	404 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	CYP4F8	P98187	520 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	KCNMA1	Q12791	1236 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	BNIP3	Q12983	259 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	GTF2H3	Q13889	308 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	UBE4A	Q14139	1066 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	EPHA7	Q15375	998 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	RALGPS1	Q5JS13	557 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	DGKH	Q86XP1	1220 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	TPH2	Q8IWU9	490 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	CNPY4	Q8N129	248 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	C7orf31	Q8N865	590 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	NETO2	Q8NC67	525 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	LMBR1	Q8WVP7	490 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	ZMAT4	Q9H898	229 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	ARNT2	Q9HBZ2	717 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	DNAJC28	Q9NX36	388 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	ACSL6	Q9UKU0	697 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM131L	A2VDJ0	1609 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	ATRN	O75882	1429 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	ADGRL3	Q9HAR2	1447 aa		6.05	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	VSTM5	A8MXK1	200 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	FZD9	O00144	591 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	ERC2	O15083	957 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	FOXP2	O15409	715 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	BUB1B	O60566	1050 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	GDF11	O95390	407 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	TGFB1	P01137	390 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	LTF	P02788	710 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	RAC2	P15153	192 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	HSPA6	P17066	643 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	SDHA	P31040	664 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	EPHA5	P54756	1037 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	MVK	Q03426	396 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	TUSC3	Q13454	348 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	MSMP	Q1L6U9	139 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	TIGD7	Q6NT04	549 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	ESPNL	Q6ZVH7	1005 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	DEFB132	Q7Z7B7	95 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	PHYKPL	Q8IUZ5	450 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	BCL7C	Q8WUZ0	217 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	PMM1	Q92871	262 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	RPS6KC1	Q96S38	1066 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	CSRNP2	Q9H175	543 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	CCM2L	Q9NUG4	571 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	DBR1	Q9UK59	544 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	PTCH1	Q13635	1447 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	ANKRD50	Q9ULJ7	1429 aa		6.04	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	UNC13B	O14795	1591 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	BLM	P54132	1417 aa	Predicted RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	PRPF3	O43395	683 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	DYRK3	O43781	588 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	CREB3	O43889	395 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	H2AFY	O75367	372 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	CD8B	P10966	210 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	MTHFD2	P13995	350 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	CD96	P40200	585 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	GPR3	P46089	330 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	LONRF3	Q496Y0	759 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	ARHGAP29	Q52LW3	1261 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	NKAPL	Q5M9Q1	402 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	FSTL4	Q6MZW2	842 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	ESRP1	Q6NXG1	681 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	CMTR2	Q8IYT2	770 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	TMEM151A	Q8N4L1	468 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	TGFBRAP1	Q8WUH2	860 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	FERMT2	Q96AC1	680 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	PEX11G	Q96HA9	241 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	AIFM3	Q96NN9	605 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	NMRK2	Q9NPI5	230 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	OBP2A	Q9NY56	170 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	ASH2L	Q9UBL3	628 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	EBF1	Q9UH73	591 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	MYO5B	Q9ULV0	1848 aa		6.03	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	C1orf167	Q5SNV9	1468 aa		6.02	□□□□□ -1.44
PUM2-208	ENST00000432105	XRN1	Q8IZH2	1706 aa	Known RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PUM2-208	ENST00000432105	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PUM2-208	ENST00000432105	UBA6	A0AVT1	1052 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PUM2-208	ENST00000432105	COBL	O75128	1261 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PUM2-208	ENST00000432105	TADA3	O75528	432 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PUM2-208	ENST00000432105	NBPF7	P0C2Y1	421 aa	Predicted RBP	6.02	□□□□□ -1.45
PUM2-208	ENST00000432105	MSL3P1	P0C860	447 aa		6.02	□□□□□ -1.45
PUM2-208	ENST00000432105	GLI4	P10075	376 aa		6.02	□□□□□ -1.45

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