RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000426282.6

NUP50-AS1-201, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene NUP50-AS1, Length 2,076 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANGEL2Q5VTE6 544 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ARHGEF16Q5VV41 709 aa20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PRAMEF18Q5VWM3 479 aa20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF572Q7Z3I7 529 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TLR10Q9BXR5 811 aa20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PACSIN1Q9BY11 444 aa20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FZD1Q9UP38 647 aa20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALCAMQ13740 583 aa20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GJB7Q6PEY0 223 aa20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 APOBEC3FQ8IUX4 373 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C4orf19Q8IY42 314 aa20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 REPS2Q8NFH8 660 aa20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 L1RE1Q9UN81 338 aa20.44■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TARSL2A2RTX5 802 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NCK2O43639 380 aa20.43■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCNE2O96020 404 aa20.43■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 JAK3P52333 1124 aa20.43■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP20.43■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYBPC2Q14324 1141 aa20.43■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C10orf76Q5T2E6 689 aa20.43■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C12orf42Q96LP6 360 aa20.43■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM150BA6NC51 233 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR64B1ANS9 1081 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 EXOC3O60645 756 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLS3P13797 630 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HMGCS2P54868 508 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KRT76Q01546 638 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ITIH3Q06033 890 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C2orf54Q08AI8 447 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CBWD6Q4V339 395 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CBWD3Q5JTY5 395 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CBWD5Q5RIA9 395 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMB7Q99436 277 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SH2D3AQ9BRG2 576 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM206Q9H813 350 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TSKSQ9UJT2 592 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PCDHGC5Q9Y5F6 944 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PALMO75781 387 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM49P0CI25 452 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRIM49CP0CI26 452 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ANXA13P27216 316 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SFNP31947 248 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CXCR5P32302 372 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PSMC5P62195 406 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SNRNP48Q6IEG0 339 aaKnown RBP20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 XRRA1Q6P2D8 792 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HDXQ7Z353 690 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SGIP1Q9BQI5 828 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SUGCTQ9HAC7 445 aa20.42■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BACH1O14867 736 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 OAZ1P54368 228 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BFSP1Q12934 665 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TIPINQ9BVW5 301 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NAGPAQ9UK23 515 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF214Q9UL59 606 aaPredicted RBP20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ADAMTS5Q9UNA0 930 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 BTNL10A8MVZ5 291 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MCM3P25205 808 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCND2P30279 289 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 DSG3P32926 999 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FAM193AP78312 1265 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VSIG10LQ86VR7 867 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRPM4Q8TD43 1214 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TMEM174Q8WUU8 243 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ACCSQ96QU6 501 aa20.41■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 WDR81Q562E7 1941 aa20.4■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NR3C2P08235 984 aa20.4■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 FERP16591 822 aa20.4■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MMGT1Q8N4V1 131 aa20.4■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 SPATA4Q8NEY3 305 aa20.4■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ST6GALNAC4Q9H4F1 302 aa20.4■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 NENFQ9UMX5 172 aa20.4■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KIAA1217Q5T5P2 1943 aa20.4■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TISP43B9A030 160 aa20.39■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C19orf81C9J6K1 198 aa20.39■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 F8VZ95 297 aa20.39■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STAT1P42224 750 aa20.39■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 MYL7Q01449 175 aa20.39■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ALKBH5Q6P6C2 394 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 VPS36Q86VN1 386 aa20.39■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 C12orf56Q8IXR9 622 aa20.39■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RDH13Q8NBN7 331 aa20.39■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GPRASP2Q96D09 838 aa20.39■□□□□ 0.86
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GFPT2O94808 682 aa20.39■□□□□ 0.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 GTF2BQ00403 316 aa20.39■□□□□ 0.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC181Q5TID7 509 aa20.39■□□□□ 0.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 PLA2G4FQ68DD2 849 aa20.39■□□□□ 0.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 ZNF771Q7L3S4 317 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 TRMT1LQ7Z2T5 733 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 HAUS6Q7Z4H7 955 aa20.39■□□□□ 0.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 CCDC125Q86Z20 511 aa20.39■□□□□ 0.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 RDM1Q8NG50 284 aa20.39■□□□□ 0.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 KLRG1Q96E93 195 aa20.39■□□□□ 0.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP20.39■□□□□ 0.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 STK33Q9BYT3 514 aa20.39■□□□□ 0.85
NUP50-AS1-201ENST00000426282 INTS2Q9H0H0 1204 aaKnown RBP20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 49.9 ms