RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412806.1

SH3BP5-204, Transcript of SH3 domain binding protein 5, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP5, Length 1,900 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP5-204ENST00000412806 EDEM3Q9BZQ6 932 aa23.67■■□□□ 1.38
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SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM206Q9H813 350 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 GBA2Q9HCG7 927 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 CYP26B1Q9NR63 512 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 PLAGL2Q9UPG8 496 aa23.67■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP23.67■■□□□ 1.38
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SH3BP5-204ENST00000412806 SOX10P56693 466 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 CDK17Q00537 523 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 TCERG1LQ5VWI1 586 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 PDXDC1Q6P996 788 aa23.66■■□□□ 1.38
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SH3BP5-204ENST00000412806 BSNDQ8WZ55 320 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 SLC35C1Q96A29 364 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 MKNK1Q9BUB5 465 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 NHEJ1Q9H9Q4 299 aaPredicted RBP23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 PDLIM7Q9NR12 457 aa23.66■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 CEP72Q9P209 647 aa23.66■■□□□ 1.38
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SH3BP5-204ENST00000412806 CACNA2D4Q7Z3S7 1137 aa23.65■■□□□ 1.38
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SH3BP5-204ENST00000412806 EFCC1Q9HA90 598 aa23.65■■□□□ 1.38
SH3BP5-204ENST00000412806 NLRC4Q9NPP4 1024 aa23.65■■□□□ 1.38
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SH3BP5-204ENST00000412806 IGKV6D-21A0A0A0MT36 114 aa23.65■■□□□ 1.38
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SH3BP5-204ENST00000412806 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa23.64■■□□□ 1.37
SH3BP5-204ENST00000412806 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP23.64■■□□□ 1.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 WDR24Q96S15 920 aa23.64■■□□□ 1.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa23.64■■□□□ 1.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 CYLC1P35663 651 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
SH3BP5-204ENST00000412806 ARHGAP25P42331 645 aa23.63■■□□□ 1.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 SLC45A1Q9Y2W3 748 aa23.63■■□□□ 1.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 GPRC5AQ8NFJ5 357 aa23.62■■□□□ 1.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 C12orf56Q8IXR9 622 aa23.61■■□□□ 1.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 SPIRE2Q8WWL2 714 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-204ENST00000412806 EIF3CQ99613 913 aaKnown RBP23.61■■□□□ 1.37
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SH3BP5-204ENST00000412806 PON1P27169 355 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-204ENST00000412806 EXOC3L4Q17RC7 722 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-204ENST00000412806 METTL7BQ6UX53 244 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-204ENST00000412806 ANKRD23Q86SG2 305 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-204ENST00000412806 FBXO16Q8IX29 292 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-204ENST00000412806 RDH13Q8NBN7 331 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-204ENST00000412806 MORC4Q8TE76 937 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-204ENST00000412806 TMEM174Q8WUU8 243 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-204ENST00000412806 TSC1Q92574 1164 aa23.61■■□□□ 1.37
SH3BP5-204ENST00000412806 MLXIPQ9HAP2 919 aa23.61■■□□□ 1.37
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