RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409911.5

LRRTM4-205, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 4, humanhuman

APPRIS ALT1 TSL 5 BASIC

Gene LRRTM4, Length 2,976 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC27A3Q5K4L6 730 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SLC9C2Q5TAH2 1124 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 RASIP1Q5U651 963 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ARHGEF18Q6ZSZ5 1173 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SPICE1Q8N0Z3 855 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 BRF1Q92994 677 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 NSMCE3Q96MG7 304 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 HAPLN3Q96S86 360 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ERP44Q9BS26 406 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 DSCC1Q9BVC3 393 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 DDX19AQ9NUU7 478 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 PANK4Q9NVE7 773 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 CTNNAL1Q9UBT7 734 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 COL1A1P02452 1464 aaPredicted RBP7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF536O15090 1300 aa7.3□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 A0A087WWV3 80 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 GPAA1O43292 621 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ATP2C2O75185 946 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SERPINB7O75635 380 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 IDH1O75874 414 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 GLI1P08151 1106 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ATP6V1C1P21283 382 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SKIV2L2P42285 1042 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SERPINB4P48594 390 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 TNNI2P48788 182 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 IKQ13123 557 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 DPYSQ14117 519 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF268Q14587 947 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 CNPY1Q3B7I2 92 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 RBM43Q6ZSC3 357 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ARL6IP6Q8N6S5 226 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 BRSK1Q8TDC3 778 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SCG3Q8WXD2 468 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 DPF3Q92784 378 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 TRPC7Q9HCX4 862 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 NARFQ9UHQ1 456 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ATPIF1Q9UII2 106 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 CDC23Q9UJX2 597 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 LRRC42Q9Y546 428 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 MROH5Q6ZUA9 1318 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF532Q9HCE3 1301 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 DOCK2Q92608 1830 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 PPP1R37O75864 691 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 GYG1P46976 350 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 B2MP61769 119 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 MRPL28Q13084 256 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 COG2Q14746 738 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 PHLDB3Q6NSJ2 640 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 LVRNQ6Q4G3 990 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SNX32Q86XE0 403 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 FAM133AQ8N9E0 248 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 CYFIP2Q96F07 1278 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 QTRT2Q9H974 415 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ETNK2Q9NVF9 386 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 PDP2Q9P2J9 529 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 GIT1Q9Y2X7 761 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 KANSL1LA0AUZ9 987 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 NOTOA8MTQ0 251 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 AKR1B15C9JRZ8 316 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 PPIP5K2O43314 1243 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 TMCC2O75069 709 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 CTDNEP1O95476 244 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 PDE6AP16499 860 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 PSMA5P28066 241 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 TM4SF1P30408 202 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 CCNFP41002 786 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SERPINB8P50452 374 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 GBE1Q04446 702 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 MTMR3Q13615 1198 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 NR1D2Q14995 579 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SH3D19Q5HYK7 790 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 PHLDB2Q86SQ0 1253 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ADGRA1Q86SQ6 560 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 LONP2Q86WA8 852 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SPATA5Q8NB90 893 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 HGH1Q9BTY7 390 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 NCOA5Q9HCD5 579 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 KCTD5Q9NXV2 234 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SAP30BPQ9UHR5 308 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 MKL2Q9ULH7 1088 aa7.29□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 CTAGE15A4D2H0 777 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 PSMD14O00487 310 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 CDK2AP1O14519 115 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 PRKAB2O43741 272 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 SEC24DO94855 1032 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 PAHP00439 452 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 CTAGE8P0CG41 777 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 RBP3P10745 1247 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 CD53P19397 219 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 ANTXR2P58335 489 aa7.28□□□□□ -1.24
LRRTM4-205ENST00000409911 DSTNP60981 165 aa7.28□□□□□ -1.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.7 ms