RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392919.4

GNPTAB-202, Transcript of N-acetylglucosamine-1-phosphate transferase subunits alpha and beta, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene GNPTAB, Length 760 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNPTAB-202ENST00000392919 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa30.37■■■□□ 2.45
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GNPTAB-202ENST00000392919 CLIC4Q9Y696 253 aa30.37■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 KDM3AQ9Y4C1 1321 aa30.37■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 NLRC5Q86WI3 1866 aa30.37■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 DDX11L8A8MPP1 907 aa30.36■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa30.36■■■□□ 2.45
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GNPTAB-202ENST00000392919 DTHD1Q6ZMT9 781 aa30.36■■■□□ 2.45
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GNPTAB-202ENST00000392919 TMEM40Q8WWA1 233 aa30.36■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP89Q96ST8 783 aa30.36■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 PPP1R16BQ96T49 567 aa30.36■■■□□ 2.45
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GNPTAB-202ENST00000392919 CATSPER3Q86XQ3 398 aa30.34■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 CRIPAKQ8N1N5 446 aa30.34■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 FIBCD1Q8N539 461 aa30.34■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 SAMD11Q96NU1 681 aa30.34■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 SH2D3AQ9BRG2 576 aa30.34■■■□□ 2.45
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GNPTAB-202ENST00000392919 GPM6BQ13491 265 aa30.33■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 MTERF2Q49AM1 385 aa30.33■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 PLA2G4FQ68DD2 849 aa30.33■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 METTL13Q8N6R0 699 aa30.33■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 ERMNQ8TAM6 284 aa30.33■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP30.33■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 USP28Q96RU2 1077 aa30.33■■■□□ 2.45
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GNPTAB-202ENST00000392919 RAB34Q9BZG1 259 aa30.33■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 TUFT1Q9NNX1 390 aa30.33■■■□□ 2.45
GNPTAB-202ENST00000392919 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa30.32■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 H3BNC9 293 aa30.32■■■□□ 2.44
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GNPTAB-202ENST00000392919 VTNP04004 478 aa30.32■■■□□ 2.44
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GNPTAB-202ENST00000392919 ZDHHC9Q9Y397 364 aa30.32■■■□□ 2.44
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GNPTAB-202ENST00000392919 RPA1P27694 616 aa30.31■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 CLCN3P51790 818 aa30.31■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 NPEPPSP55786 919 aa30.31■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 LINC01465Q8N7H1 131 aa30.31■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP30.31■■■□□ 2.44
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GNPTAB-202ENST00000392919 CYP26B1Q9NR63 512 aa30.31■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 COG5Q9UP83 839 aa30.31■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 MGEA5O60502 916 aa30.3■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 RPS6KA5O75582 802 aa30.3■■■□□ 2.44
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GNPTAB-202ENST00000392919 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP30.3■■■□□ 2.44
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GNPTAB-202ENST00000392919 GPR32O75388 356 aa30.29■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 CDC25AP30304 524 aa30.29■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa30.29■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP30.29■■■□□ 2.44
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GNPTAB-202ENST00000392919 OTUD6AQ7L8S5 288 aa30.29■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 LRRC71Q8N4P6 559 aa30.29■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa30.29■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 XIRP2A4UGR9 3374 aa30.29■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 CTNNB1P35222 781 aa30.28■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 CCT6AP40227 531 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 GATMP50440 423 aa30.28■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 GRIN1Q05586 938 aa30.28■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 AAK1Q2M2I8 961 aa30.28■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 EFCAB12Q6NXP0 572 aa30.28■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 NPAS4Q8IUM7 802 aa30.28■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 SNX29Q8TEQ0 813 aa30.28■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 CEP170P1Q96L14 293 aa30.28■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 UHRF1Q96T88 793 aaPredicted RBP30.28■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 MMTAG2Q9BU76 263 aaKnown RBP30.28■■■□□ 2.44
GNPTAB-202ENST00000392919 STK24Q9Y6E0 443 aa30.28■■■□□ 2.44
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