RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000387416.2

MT-TS1-201, Transcript of mitochondrially encoded tRNA serine 1 (UCN), humanhuman

BASIC

Gene MT-TS1, Length 69 nt, Biotype Mt tRNA, Subcellular localisation Exosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MT-TS1-201ENST00000387416 CRIPAKQ8N1N5 446 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 LRRC71Q8N4P6 559 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 FBXO22Q8NEZ5 403 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 NLRP7Q8WX94 980 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 DYDC2Q96IM9 177 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 NACC1Q96RE7 527 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 OSMRQ99650 979 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 ADAM2Q99965 735 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 POLR3CQ9BUI4 534 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 PLVAPQ9BX97 442 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP9.5□□□□□ -0.89
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MT-TS1-201ENST00000387416 DACT1Q9NYF0 836 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 RGL1Q9NZL6 768 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 PCDHB7Q9Y5E2 793 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 COL4A6Q14031 1691 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 PTPRSQ13332 1948 aa9.5□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 COL6A3P12111 3177 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 LCHNA4D1U4 455 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 CARNS1A5YM72 827 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 DGAT1O75907 488 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 DGKIO75912 1065 aa9.49□□□□□ -0.89
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MT-TS1-201ENST00000387416 SKIP12755 728 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 RPA1P27694 616 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 GJB2P29033 226 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 PRPHP41219 470 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 POU5F1BQ06416 359 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 BTG3Q14201 252 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
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MT-TS1-201ENST00000387416 CTTNQ14247 550 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 DSC3Q14574 896 aa9.49□□□□□ -0.89
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MT-TS1-201ENST00000387416 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 HAUS3Q68CZ6 603 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 MCTP1Q6DN14 999 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 SRGAP1Q7Z6B7 1085 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 FAM228AQ86W67 206 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM192Q8IY95 271 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 KCTD17Q8N5Z5 321 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM40Q8WWA1 233 aa9.49□□□□□ -0.89
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MT-TS1-201ENST00000387416 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 LMAN2LQ9H0V9 348 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 TMEM60Q9H2L4 133 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 TMX1Q9H3N1 280 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa9.49□□□□□ -0.89
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MT-TS1-201ENST00000387416 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa9.49□□□□□ -0.89
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MT-TS1-201ENST00000387416 SIP14410 1827 aa9.49□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 C9IYK1 514 aa9.48□□□□□ -0.89
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MT-TS1-201ENST00000387416 H3BNC9 293 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 BMP15O95972 392 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 BMPR1AP36894 532 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 NPEPPSP55786 919 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 CYP4A11Q02928 519 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 PTGDRQ13258 359 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 GRB10Q13322 594 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 CUL4AQ13619 759 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 TFDP1Q14186 410 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 EMC2Q15006 297 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 AAK1Q2M2I8 961 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 EPC2Q52LR7 807 aa9.48□□□□□ -0.89
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MT-TS1-201ENST00000387416 C4orf32Q8N8J7 132 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 MCPH1Q8NEM0 835 aa9.48□□□□□ -0.89
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MT-TS1-201ENST00000387416 LINC01599Q8WXQ3 324 aa9.48□□□□□ -0.89
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MT-TS1-201ENST00000387416 CERS4Q9HA82 394 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 AAASQ9NRG9 546 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 LRWD1Q9UFC0 647 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 COG5Q9UP83 839 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 MTCH2Q9Y6C9 303 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa9.48□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 BDP1A6H8Y1 2624 aa9.47□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A087WZ62 844 aa9.47□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 A0A0U1RQF3 1178 aa9.47□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 SLC26A4O43511 780 aa9.47□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 NCK2O43639 380 aa9.47□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 ARHGEF15O94989 841 aa9.47□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 CD2BP2O95400 341 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa9.47□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 TECP42680 631 aa9.47□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 PHKA2P46019 1235 aa9.47□□□□□ -0.89
MT-TS1-201ENST00000387416 RAB27AP51159 221 aa9.47□□□□□ -0.89
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