RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000366197.9

ZNF548-202, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene ZNF548, Length 4,955 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-202ENST00000366197 KRT3P12035 628 aa11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SPATS2Q86XZ4 545 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 STAG2Q8N3U4 1231 aa11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CEP72Q9P209 647 aa11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ENTPD3O75355 529 aa11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 KCNV1Q6PIU1 500 aa11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CFAP61Q8NHU2 1237 aa11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 LPAR1Q92633 364 aa11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 MRPL4Q9BYD3 311 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 GOLGA8QA0A0J9YX86 632 aa11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC151A5D8V7 595 aa11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 GOLGA8OA6NCC3 632 aa11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 GOLGA8NF8WBI6 632 aa11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CCDC188H7C350 402 aa11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 RWDD4Q6NW29 188 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TMTC4Q5T4D3 741 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 VPS39Q96JC1 886 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ZWILCHQ9H900 591 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 VCX3AQ9NNX9 186 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TJP3O95049 919 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CSF1RP07333 972 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TBXAS1P24557 533 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 GPC3P51654 580 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 VAMP7P51809 220 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 STX1BP61266 288 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ADCY1Q08828 1119 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SEMA3FQ13275 785 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SEPT6Q14141 434 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TRIP13Q15645 432 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SLC10A5Q5PT55 438 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 KRT39Q6A163 491 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TTC39CQ8N584 583 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 FMO2Q99518 471 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 STRIP2Q9ULQ0 834 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 IQGAP3Q86VI3 1631 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 F8W8V4 182 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ATP8B1O43520 1251 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 PMLP29590 882 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 DR1Q01658 176 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 C1orf228Q6PIY5 440 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 NDUFAF2Q8N183 169 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 FGGP02679 453 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TXNP10599 105 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 RECQLP46063 649 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 STAT5BP51692 787 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 GPC5P78333 572 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF543Q08ER8 600 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SBK1Q52WX2 424 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 HHIPL2Q6UWX4 724 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 PYROXD1Q8WU10 500 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SLC9A2Q9UBY0 812 aa11.06□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 EXOC1LA0A1B0GW35 172 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 PP2D1A8MPX8 630 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 C19orf81C9J6K1 198 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 NDUFB10O96000 172 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CALB1P05937 261 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 PPARGP37231 505 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 MTMR2Q13614 643 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 HAUS6Q7Z4H7 955 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 RBM41Q96IZ5 413 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ALDH8A1Q9H2A2 487 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ADAMTS13Q76LX8 1427 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SPDYE2BA6NHP3 402 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SPDYE6P0CI01 402 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ATP2C1P98194 919 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 C2orf54Q08AI8 447 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SARM1Q6SZW1 724 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 LRRC31Q6UY01 552 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CENPUQ71F23 418 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SRBD1Q8N5C6 995 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TTC13Q8NBP0 860 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 C11orf70Q9BRQ4 267 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 POLR3FQ9H1D9 316 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ASNSD1Q9NWL6 643 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 STAP1Q9ULZ2 295 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 USH1CQ9Y6N9 552 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CLTCL1P53675 1640 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 RASGRF2O14827 1237 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SDC4P31431 198 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 PDIA5Q14554 519 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TMED2Q15363 201 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 HSPH1Q92598 858 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 CHMP6Q96FZ7 201 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TTC25Q96NG3 672 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 AP1M1Q9BXS5 423 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 NYAP2Q9P242 653 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 MID2Q9UJV3 735 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 TAF1CQ15572 869 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 URGCPQ8TCY9 931 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 WHAMMQ8TF30 809 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 ELP3Q9H9T3 547 aa11.05□□□□□ -0.64
ZNF548-202ENST00000366197 FLT1P17948 1338 aa11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms