RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 CR2P20023 1033 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 LSP1P33241 339 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOX5P35711 763 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEA10P43363 369 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 PHC1P78364 1004 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAM15Q13444 863 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHCR24Q15392 516 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 TBR1Q16650 682 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 CT47A1Q5JQC4 288 aaPredicted RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR158Q5T848 1215 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 ESPNLQ6ZVH7 1005 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR14K1Q8NGZ2 314 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 CHAC2Q8WUX2 184 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 FERMT2Q96AC1 680 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 DYDC2Q96IM9 177 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 DPYSL5Q9BPU6 564 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 C12orf65Q9H3J6 166 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 CAAP1Q9H8G2 361 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAGEL2Q9UJ55 1249 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 DENND2AQ9ULE3 1009 aa4.42□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 PATE3B3GLJ2 98 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 OPHN1O60890 802 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADRB1P08588 477 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 BPIP17213 487 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 SESN2P58004 480 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 STRN3Q13033 797 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 ICAM4Q14773 271 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 TERF2Q15554 542 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDB1Q16531 1140 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 ATP13A4Q4VNC1 1196 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 TCTN3Q6NUS6 607 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 KANSL1Q7Z3B3 1105 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 TAX1BP1Q86VP1 789 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 UBR7Q8N806 425 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF610Q8N9Z0 462 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNERQ8NFT8 737 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 CFHR4Q92496 578 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC5A5Q92911 643 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 GFM2Q969S9 779 aaKnown RBP4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC1Q99614 292 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 PITHD1Q9GZP4 211 aaPredicted RBP4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 HAPLN2Q9GZV7 340 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 SEMA4AQ9H3S1 761 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 IFT22Q9H7X7 185 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 MSL2Q9HCI7 577 aa4.41□□□□□ -1.7
RNU6-552P-201ENST00000362869 MATN2O00339 956 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 KDM1AO60341 852 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 RAB11FIP3O75154 756 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 MASP1P48740 699 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANTXR2P58335 489 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADAM17P78536 824 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 HGFACQ04756 655 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBTB41Q5SVQ8 909 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 BROXQ5VW32 411 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 UNQ6494/PRO21346Q6UXR6 183 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 GCDHQ92947 438 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 LPPQ93052 612 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 NKD2Q969F2 451 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 WDR92Q96MX6 357 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 OR14A2Q96R54 314 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 PLA2G12BQ9BX93 195 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 MS4A5Q9H3V2 200 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAI1Q9UI46 699 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 SYNPO2Q9UMS6 1093 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFR2Q9UPR6 939 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 APOBEC2Q9Y235 224 aaKnown RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRKAB1Q9Y478 270 aa4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 A0A0A6YYJ9 748 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 LCHNA4D1U4 455 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 NEMP1O14524 444 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC26A4O43511 780 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 FOXS1O43638 330 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZEB2O60315 1214 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF623O75123 536 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 PCDH8O95206 1070 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF20P17024 532 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 CNGA1P29973 690 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 SELENOPP49908 381 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 NFKB2Q00653 900 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 DUSP8Q13202 625 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 EGFLAMQ63HQ2 1017 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZNF585AQ6P3V2 769 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 FRMD7Q6ZUT3 714 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 HDGFL2Q7Z4V5 671 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 CXorf67Q86X51 503 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 FUKQ8N0W3 1084 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIST1H2AHQ96KK5 128 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIST1H2AJQ99878 128 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 DEF6Q9H4E7 631 aa4.39□□□□□ -1.71
RNU6-552P-201ENST00000362869 CD248Q9HCU0 757 aa4.39□□□□□ -1.71
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 19.8 ms