RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 RTN4RL1Q86UN2 441 aaPredicted RBP8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 FAM228AQ86W67 206 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 NPAS4Q8IUM7 802 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM192Q8IY95 271 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 SLFN12Q8IYM2 578 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 CRIPAKQ8N1N5 446 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF710Q8N1W2 664 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 HAS1Q92839 578 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 SCLT1Q96NL6 688 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 LRFN2Q9ULH4 789 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 ST3GAL5Q9UNP4 418 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 RWDD3Q9Y3V2 267 aa8.6□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 DDX11L8A8MPP1 907 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 H3BNC9 293 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 NEMFO60524 1076 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 STBD1O95210 358 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 BAG4O95429 457 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 LINC00271P0C7V0 271 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 COL9A1P20849 921 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 QARSP47897 775 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 SARSP49591 514 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 DNM2P50570 870 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 GPC3P51654 580 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 GUCY1B3Q02153 619 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 TFF2Q03403 129 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 SPIRE1Q08AE8 756 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 PDAP1Q13442 181 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 GPM6BQ13491 265 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 SAFBQ15424 915 aaKnown RBP eCLIP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 CALCRLQ16602 461 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 PLA2G4FQ68DD2 849 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 NCAPH2Q6IBW4 605 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 ANO5Q75V66 913 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF689Q96CS4 500 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 C8orf76Q96K31 380 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF668Q96K58 619 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 ASB2Q96Q27 587 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 CEP89Q96ST8 783 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 ADAM2Q99965 735 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 SH2D3AQ9BRG2 576 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 LXNQ9BS40 222 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTS10Q9H324 1103 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf112Q9NSG2 853 aa8.59□□□□□ -1.03
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 C5orf67F2Z3F1 127 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 WNT7AO00755 349 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 MAFO75444 373 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 P4HBP07237 508 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 GATMP50440 423 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 HMGN5P82970 282 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CYP4A11Q02928 519 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 DRP2Q13474 957 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 EPHA7Q15375 998 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PTPROQ16827 1216 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TIGD5Q53EQ6 642 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 SLC24A5Q71RS6 500 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 NLRP7Q8WX94 980 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 SLC7A3Q8WY07 619 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 DYDC2Q96IM9 177 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 JPH2Q9BR39 696 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CYP26B1Q9NR63 512 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 RGS18Q9NS28 235 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB8Q9UN66 801 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 COG5Q9UP83 839 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 PCDHB13Q9Y5F0 798 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 MYO7AQ13402 2215 aa8.58□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 C9IYK1 514 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF10AO00220 468 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 RB1P06400 928 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 DARSP14868 501 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 YWHABP31946 246 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 BMPR1AP36894 532 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 NPEPPSP55786 919 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CDC42EP1Q00587 391 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 GNL2Q13823 731 aaKnown RBP8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 DSC3Q14574 896 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 AAK1Q2M2I8 961 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF410Q86VK4 478 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 RHPN2Q8IUC4 686 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 C4orf19Q8IY42 314 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 FAM184AQ8NB25 1140 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ADAMTS19Q8TE59 1207 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 HLA-CQ95604 372 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 CEP170P1Q96L14 293 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 ZSWIM4Q9H7M6 989 aa8.57□□□□□ -1.04
SGMS1-201ENST00000361543 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP8.57□□□□□ -1.04
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