RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361496.3

RCSD1-201, Transcript of RCSD domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene RCSD1, Length 822 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RCSD1-201ENST00000361496 SLC24A5Q71RS6 500 aa22.23■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 RC3H2Q9HBD1 1191 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 ADGRA3Q8IWK6 1321 aa22.23■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 PRRC2BQ5JSZ5 2229 aaKnown RBP22.23■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 ZBTB39O15060 712 aa22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 GPM6BQ13491 265 aa22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 XKR9Q5GH70 373 aa22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 RHPN2Q8IUC4 686 aa22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 NOSTRINQ8IVI9 506 aa22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 EXOC8Q8IYI6 725 aa22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 SLC7A3Q8WY07 619 aa22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 HSD17B14Q9BPX1 270 aa22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 KIF3AQ9Y496 699 aa22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 PPME1Q9Y570 386 aa22.22■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 C9IYK1 514 aa22.21■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 H3BNC9 293 aa22.21■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 ZSCAN20P17040 1043 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 BMPR1AP36894 532 aa22.21■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 POLGP54098 1239 aaPredicted RBP22.21■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 DSC3Q14574 896 aa22.21■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP22.21■■□□□ 1.15
RCSD1-201ENST00000361496 A0A087WZ62 844 aa22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 FGFR4P22455 802 aa22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 CTNNB1P35222 781 aa22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 RFC5P40937 340 aa22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 FAM189BP81408 668 aa22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 PAN2Q504Q3 1202 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 TTC38Q5R3I4 469 aa22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 CMTR2Q8IYT2 770 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 NEK9Q8TD19 979 aa22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 FDXACB1Q9BRP7 624 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 DHX33Q9H6R0 707 aaKnown RBP22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 THEGQ9P2T0 379 aa22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 RWDD3Q9Y3V2 267 aa22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 COL4A4P53420 1690 aaPredicted RBP22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 COL4A6Q14031 1691 aa22.2■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 EYSQ5T1H1 3165 aa22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 RB1P06400 928 aa22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 U2AF2P26368 475 aaKnown RBP eCLIP22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 TECP42680 631 aa22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 TRAPPC10P48553 1259 aa22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 GATMP50440 423 aa22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 ORC2Q13416 577 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 ZNF410Q86VK4 478 aa22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 KSR1Q8IVT5 923 aa22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 ATXN2LQ8WWM7 1075 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 TMEM143Q96AN5 459 aa22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 INO80BQ9C086 356 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 BMP2KQ9NSY1 1161 aaPredicted RBP22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 NLRC5Q86WI3 1866 aa22.19■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 POTEMA6NI47 508 aa22.18■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 LYPLA2O95372 231 aa22.18■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 OR52Z1P0C646 297 aa22.18■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 LINC00271P0C7V0 271 aa22.18■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 PTPROQ16827 1216 aa22.18■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 FAM102BQ5T8I3 360 aa22.18■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 NLRP4Q96MN2 994 aa22.18■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa22.18■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 ANKEF1Q9NU02 776 aa22.18■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 TMEM161AQ9NX61 479 aa22.18■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 MRPL42Q9Y6G3 142 aaKnown RBP22.18■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 A0A087WWV3 80 aa22.17■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 C5orf67F2Z3F1 127 aa22.17■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 GJB2P29033 226 aa22.17■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 MCTP1Q6DN14 999 aa22.17■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 TCP11Q8WWU5 503 aa22.17■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 PRPF31Q8WWY3 499 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 PSPC1Q8WXF1 523 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 MRPL38Q96DV4 380 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 C11orf84Q9BUA3 381 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP22.17■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 ELAC1Q9H777 363 aaKnown RBP22.17■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa22.17■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 RALGAPA2Q2PPJ7 1873 aa22.16■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 TBKBP1A7MCY6 615 aa22.16■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 GAS2O43903 313 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 SRGAP2CP0DJJ0 459 aa22.16■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 MRPS5P82675 430 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 NBR1Q14596 966 aa22.16■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 EMC2Q15006 297 aa22.16■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 CCDC43Q96MW1 224 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 MTRQ99707 1265 aa22.16■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 SMC3Q9UQE7 1217 aa22.16■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 ASAP2O43150 1006 aa22.15■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 SPATA31C1P0DKV0 1188 aa22.15■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 XRCC6P12956 609 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 SFPQP23246 707 aaKnown RBP eCLIP22.15■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 TOB1P50616 345 aaPredicted RBP22.15■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 LAMTOR4Q0VGL1 99 aa22.15■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 TJAP1Q5JTD0 557 aa22.15■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.15■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 ERMNQ8TAM6 284 aa22.15■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 PIGOQ8TEQ8 1089 aa22.15■■□□□ 1.14
RCSD1-201ENST00000361496 ASB2Q96Q27 587 aa22.15■■□□□ 1.14
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