RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 RGPD8O14715 1765 aaPredicted RBP16.75■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 STAT2P52630 851 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 EIF2AK1Q9BQI3 630 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 RAB20Q9NX57 234 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 CD19P15391 556 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 LRRC8CQ8TDW0 803 aa16.74■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 THOC1Q96FV9 657 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 MAK16Q9BXY0 300 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 F5H6K3 240 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 HNRNPDLO14979 420 aaKnown RBP16.74■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 CCDC89Q8N998 374 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 LINC00116Q8NCU8 138 aa16.74■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 SERPINA10Q9UK55 444 aa16.74■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 CCPG1Q9ULG6 757 aa16.74■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 CYP11B2P19099 503 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 PEX19P40855 299 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 NBPF9Q3BBW0 867 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 MIIPQ5JXC2 388 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 CCDC62Q6P9F0 684 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 SLC20A2Q08357 652 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 AOC3Q16853 763 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 TPCN2Q8NHX9 752 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 BLOC1S4Q9NUP1 217 aa16.73■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 GGT7Q9UJ14 662 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 SIK3Q9Y2K2 1263 aa16.73■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 TRPC3Q13507 836 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 RGPD1P0DJD0 1748 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 LTN1O94822 1766 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 SESN3P58005 492 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 DRP2Q13474 957 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 DLGAP5Q15398 846 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 FAM47EQ6ZV65 393 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 BANK1Q8NDB2 785 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 SORBS3O60504 671 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 DHX34Q14147 1143 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 TMEM179Q6ZVK1 233 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 PALM2Q8IXS6 379 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 GLG1Q92896 1179 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 XPO6Q96QU8 1125 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 STK33Q9BYT3 514 aa16.72■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 AGBL2Q5U5Z8 902 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 RNF207Q6ZRF8 634 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP16.72■□□□□ 0.27
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PTPRU-201ENST00000345512 HEMGNQ9BXL5 484 aa16.72■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 EYA4O95677 639 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 MKRN4PQ13434 485 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 RPAINQ86UA6 219 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 GPR75-ASB3A0A0A6YYF3 556 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 CLRN2A0PK11 232 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 SLIT3O75094 1523 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 ZC2HC1CQ53FD0 456 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF571Q7Z3V5 609 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 EMSYQ7Z589 1322 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 FMO5P49326 533 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 PEX3P56589 373 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 CATSPER3Q86XQ3 398 aa16.71■□□□□ 0.27
PTPRU-201ENST00000345512 TRIM59Q8IWR1 403 aa16.71■□□□□ 0.27
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