RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000340994.4

PKHD1-201, Transcript of PKHD1, fibrocystin/polyductin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PKHD1, Length 11,589 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKHD1-201ENST00000340994 TFDP1Q14186 410 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 TJAP1Q5JTD0 557 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 SCYL2Q6P3W7 929 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 TTC17Q96AE7 1141 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 UBAP1Q9NZ09 502 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 SLC12A6Q9UHW9 1150 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 GSPT1P15170 499 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 UHMK1Q8TAS1 419 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 WDR62O43379 1518 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 FTCDO95954 541 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 DLATP10515 647 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 FAM102BQ5T8I3 360 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 IKBIPQ70UQ0 350 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 PASD1Q8IV76 773 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 CYFIP2Q96F07 1278 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 IL17RAQ96F46 866 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ANKRD36BP1Q96IX9 119 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 PPP1R2P1Q96PQ5 205 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 WDR19Q8NEZ3 1342 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 H2AFYO75367 372 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 PALMO75781 387 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 SCRN1Q12765 414 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 FBXW10Q5XX13 1052 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 SEL1LQ9UBV2 794 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 RFX7Q2KHR2 1363 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 FAM25AB3EWG3 89 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 FAM25CB3EWG5 89 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 FAM25GB3EWG6 89 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ARMCX5Q6P1M9 558 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 FAM47EQ6ZV65 393 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 OTUD7AQ8TE49 926 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 TRPC7Q9HCX4 862 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 HACD3Q9P035 362 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 CFAP69A5D8W1 941 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 CCNE1P24864 410 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ODR4Q5SWX8 454 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 BTNL9Q6UXG8 535 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 HIPK4Q8NE63 616 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 TADA1Q96BN2 335 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 HPCAL4Q9UM19 191 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF532Q9HCE3 1301 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF263O14978 683 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 XPO1O14980 1071 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 CLASP2O75122 1294 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 CAPN1P07384 714 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 VCPP55072 806 aaKnown RBP8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF827Q17R98 1081 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 SPDYE2Q495Y8 402 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ACCSQ96QU6 501 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 DISC1Q9NRI5 854 aa8.75□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 DLGAP3O95886 979 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 RCAN1P53805 252 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 DMC1Q14565 340 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 TTC39CQ8N584 583 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 FLCNQ8NFG4 579 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ZNF473Q8WTR7 871 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 TEKT4Q8WW24 435 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 EPC1Q9H2F5 836 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 CDY2AQ9Y6F7 541 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 CDY1Q9Y6F8 540 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 STX7O15400 261 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 NBNO60934 754 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 TAP1Q03518 808 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 TMC5Q6UXY8 1006 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 LINC00301Q8NCQ3 95 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 MED10Q9BTT4 135 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 DLGAP2Q9P1A6 1054 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 BIN2Q9UBW5 565 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 PCDHA4Q9UN74 947 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ACEP12821 1306 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 SAC3D1A6NKF1 404 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ASNA1O43681 348 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 TECP42680 631 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 CLK1P49759 484 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ZCWPW2Q504Y3 356 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 RANBP17Q9H2T7 1088 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 FBXO2Q9UK22 296 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 PGBD1Q96JS3 809 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 VCPKMTQ9H867 229 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 GRIN2AQ12879 1464 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 PRR23AA6NEV1 266 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 BBS9Q3SYG4 887 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 TRIM72Q6ZMU5 477 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 SSH3Q8TE77 659 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 ARMT1Q9H993 441 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 PJA2O43164 708 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 RHOBTB1O94844 696 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 PURAQ00577 322 aaKnown RBP8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 A0A1W2PQC6 194 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 WDR64B1ANS9 1081 aa8.74□□□□□ -1.01
PKHD1-201ENST00000340994 SNX2O60749 519 aa8.74□□□□□ -1.01
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 42.9 ms