RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329078.7

SPNS2-201, Transcript of sphingolipid transporter 2, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPNS2, Length 3,447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS2-201ENST00000329078 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP21.56■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PGRMC1O00264 195 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 CPP00450 1065 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 HOXD13P35453 343 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 IFI16Q16666 785 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 IRF2BP2Q7Z5L9 587 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 NLRP14Q86W24 1093 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC13Q8IYE1 715 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 CERKQ8TCT0 537 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 GLG1Q92896 1179 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PARVGQ9HBI0 331 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 TAS2R14Q9NYV8 317 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 GGT7Q9UJ14 662 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 AMFRQ9UKV5 643 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 ARP10275 920 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 NPR1P16066 1061 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 FLT3P36888 993 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 SEMA3FQ13275 785 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 MESDQ14696 234 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 NAA25Q14CX7 972 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 UBE2TQ9NPD8 197 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 TYW1Q9NV66 732 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 BAIAP2L1Q9UHR4 511 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 CTDP1Q9Y5B0 961 aaPredicted RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 GJC1P36383 396 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 DHX9Q08211 1270 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 NSMFQ6X4W1 530 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 SLC35C1Q96A29 364 aa21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 NAP1L4Q99733 375 aaKnown RBP21.55■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PJA2O43164 708 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 C21orf2O43822 256 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 SLCO1A2P46721 670 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 NAIF1Q69YI7 327 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 C15orf52Q6ZUT6 534 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 SIAH1Q8IUQ4 282 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 ETNPPLQ8TBG4 499 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 FBXL5Q9UKA1 691 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 CCDC169A6NNP5 214 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 DDX3XO00571 662 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PPP1R37O75864 691 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 MYZAPP0CAP1 466 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 POLR2MP0CAP2 368 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 ADRA2BP18089 450 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PLTPP55058 493 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 RRP1BQ14684 758 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 SPRED3Q2MJR0 410 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 CBWD6Q4V339 395 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 CBWD3Q5JTY5 395 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 CBWD5Q5RIA9 395 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 MSL3Q8N5Y2 521 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 DCAF4Q8WV16 495 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 DNAJC17Q9NVM6 304 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
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SPNS2-201ENST00000329078 SSR1P43307 286 aaKnown RBP21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 ZNF662Q6ZS27 426 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PALB2Q86YC2 1186 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PPM1KQ8N3J5 372 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 SLC35G2Q8TBE7 412 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 SELENOSQ9BQE4 189 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 NR2E1Q9Y466 385 aa21.54■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 CALCAP01258 141 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 DGKZQ13574 1117 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 MICALCLQ6ZW33 695 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 ZKSCAN4Q969J2 545 aaPredicted RBP21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 SH3GL2Q99962 352 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 ASTN1O14525 1302 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PHF20L1A8MW92 1017 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 CHADLQ6NUI6 762 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 HHIPL2Q6UWX4 724 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 MYCBPAPQ8TBZ2 947 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 GLT8D2Q9H1C3 349 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 SNX24Q9Y343 169 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.53■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 H0YIN7 160 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 ALAS1P13196 640 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 PRLRP16471 622 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 NT5C2P49902 561 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 AP3B2Q13367 1082 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 EDRF1Q3B7T1 1238 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 CPLX4Q7Z7G2 160 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 TPCN2Q8NHX9 752 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 WDR18Q9BV38 432 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 VPS41P49754 854 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 MYL7Q01449 175 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 FRMD5Q7Z6J6 570 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 EDEM3Q9BZQ6 932 aa21.52■■□□□ 1.04
SPNS2-201ENST00000329078 SLC40A1Q9NP59 571 aa21.52■■□□□ 1.04
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