RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 TBC1D7Q9P0N9 293 aa11.18□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 PCDHA2Q9Y5H9 948 aa11.18□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ZBTB39O15060 712 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 COBLO75128 1261 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 GNA14O95837 355 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 CCNE2O96020 404 aa11.17□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 LRRC41Q15345 812 aa11.17□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 SWSAP1Q6NVH7 229 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ANKRD13CQ8N6S4 541 aa11.17□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC150Q8NCX0 1101 aa11.17□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 OLFML3Q9NRN5 406 aa11.17□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 ACTR2P61160 394 aa11.16□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 ABHD15Q6UXT9 468 aa11.16□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 SFR1Q86XK3 245 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC17A8Q8NDX2 589 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 EFCC1Q9HA90 598 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 SLC5A4Q9NY91 659 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 WRAP73Q9P2S5 460 aaPredicted RBP11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 GABBR1Q9UBS5 961 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 MORF4L1Q9UBU8 362 aa11.16□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 UCHL5Q9Y5K5 329 aaKnown RBP eCLIP11.16□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 SFI1A8K8P3 1242 aa11.15□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 CALUO43852 315 aaPredicted RBP11.15□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 RARRES1P49788 294 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF131P52739 623 aa11.15□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 ZNF507Q8TCN5 953 aa11.15□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 SCFD1Q8WVM8 642 aa11.15□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 CEP63Q96MT8 703 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 TUBGCP2Q9BSJ2 902 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 VPS16Q9H269 839 aa11.15□□□□□ -0.62
RABGGTB-201ENST00000319942 MLXIPQ9HAP2 919 aa11.15□□□□□ -0.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 HIP1RO75146 1068 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-201ENST00000319942 ATG7O95352 703 aa11.14□□□□□ -0.63
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RABGGTB-201ENST00000319942 DNM2P50570 870 aa11.14□□□□□ -0.63
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RABGGTB-201ENST00000319942 FKBP15Q5T1M5 1219 aa11.14□□□□□ -0.63
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RABGGTB-201ENST00000319942 DPP9Q86TI2 863 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-201ENST00000319942 NELFCDQ8IXH7 590 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-201ENST00000319942 CCDC112Q8NEF3 446 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-201ENST00000319942 MORC4Q8TE76 937 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-201ENST00000319942 SEPT1Q8WYJ6 367 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-201ENST00000319942 NOC4LQ9BVI4 516 aaKnown RBP11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-201ENST00000319942 PORCNQ9H237 461 aa11.14□□□□□ -0.63
RABGGTB-201ENST00000319942 TAB2Q9NYJ8 693 aa11.14□□□□□ -0.63
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