RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000318066.6

UBE2N-201, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 N, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene UBE2N, Length 5,186 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2N-201ENST00000318066 MTRQ99707 1265 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 SNX5Q9Y5X3 404 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 MRFAP1Q9Y605 127 aa20.3■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 ZBTB5O15062 677 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 SLC26A4O43511 780 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 AP3M2P53677 418 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 NAALADL2Q58DX5 795 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 ATP11CQ8NB49 1132 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 PIH1D3Q9NQM4 214 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 COPS2P61201 443 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 SPICE1Q8N0Z3 855 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 KRT76Q01546 638 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 KCNH2Q12809 1159 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 MORF4L2Q15014 288 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 IP6K2Q9UHH9 426 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 L3MBTL1Q9Y468 752 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 SERPINB2P05120 415 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 PRELPP51888 382 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 ARFIP2P53365 341 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 EPHB1P54762 984 aa20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 KNOP1Q1ED39 458 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 ZMAT2Q96NC0 199 aaKnown RBP20.29■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 MECOMQ03112 1051 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 APOL6Q9BWW8 343 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 SPDYE2BA6NHP3 402 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 SPDYE6P0CI01 402 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 BRAFP15056 766 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 MTBPQ96DY7 904 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 ATP6V0A4Q9HBG4 840 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 UBN1Q9NPG3 1134 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 FBXO40Q9UH90 709 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 CD58P19256 250 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 SFNP31947 248 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 STAT4Q14765 748 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 A0A087WWV3 80 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 USP17L8P0C7I0 530 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 SOX5P35711 763 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 C1orf146Q5VVC0 180 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 TTLL11Q8NHH1 800 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 RFFLQ8WZ73 363 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 BTBD6Q96KE9 485 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 TOPORSQ9NS56 1045 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF212Q9UDV6 495 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 EFCAB6Q5THR3 1501 aa20.28■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 TMED1Q13445 227 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 TEX12Q9BXU0 123 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 PRCPP42785 496 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 HDAC4P56524 1084 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 GRAPQ13588 217 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 RHOT1Q8IXI2 618 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 AIFM3Q96NN9 605 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 NGRNQ9NPE2 291 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 ASNSP08243 561 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 YWHAHQ04917 246 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 KSR1Q8IVT5 923 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 SNF8Q96H20 258 aa20.27■□□□□ 0.84
UBE2N-201ENST00000318066 ZFXP17010 805 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 UBXN2AP68543 259 aa20.27■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 BYSLQ13895 437 aaKnown RBP20.27■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 BEND6Q5SZJ8 279 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 SPDYE1Q8NFV5 336 aaPredicted RBP20.27■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 GRAMD4Q6IC98 578 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ANLNQ9NQW6 1124 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ASAP1Q9ULH1 1129 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 CAPN11Q9UMQ6 739 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 TSTA3Q13630 321 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 UBE2SQ16763 222 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 KIF19Q2TAC6 998 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 PDXDC1Q6P996 788 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 TRMT10CQ7L0Y3 403 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ZNF564Q8TBZ8 553 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 KIF2CQ99661 725 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 FOXP3Q9BZS1 431 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 SEC31BQ9NQW1 1179 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 PEX3P56589 373 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 SGMS1Q86VZ5 419 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ING2Q9H160 280 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 PLEKHA8P1O95397 391 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 LRIG3Q6UXM1 1119 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 CDKL3Q8IVW4 592 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 MB21D2Q8IYB1 491 aaPredicted RBP20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 BATF3Q9NR55 127 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 STAP1Q9ULZ2 295 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ARHGAP26Q9UNA1 814 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ERBB3P21860 1342 aa20.26■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 AP3B1O00203 1094 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 FDX1P10109 184 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 COASYQ13057 564 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 ITPRIPL1Q6GPH6 555 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 C2orf40Q9H1Z8 148 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa20.25■□□□□ 0.83
UBE2N-201ENST00000318066 SLC1A1P43005 524 aa20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.4 ms