RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296026.4

CXCL3-201, Transcript of C-X-C motif chemokine ligand 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CXCL3, Length 1,075 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3-201ENST00000296026 TLE6Q9H808 572 aa22.12■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 TLR9Q9NR96 1032 aa22.12■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 TDP2O95551 362 aa22.11■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 EYA4O95677 639 aa22.11■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 LAG3P18627 525 aa22.11■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 GPC3P51654 580 aa22.11■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa22.11■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa22.11■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 MIER3Q7Z3K6 550 aa22.11■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 BLIDQ8IZY5 108 aa22.11■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 SCLT1Q96NL6 688 aa22.11■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM117Q9H0C3 514 aa22.11■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 CYP3A7-CYP3A51PA0A087WV96 503 aa22.1■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 M0R2N6 131 aa22.1■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 HOXA2O43364 376 aa22.1■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 GLP2RO95838 553 aa22.1■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 CYP3A7P24462 503 aa22.1■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 ERVFC1P60507 584 aa22.1■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 STK3Q13188 491 aa22.1■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 RDM1Q8NG50 284 aa22.1■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 CASD1Q96PB1 797 aa22.1■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 TM6SF1Q9BZW5 370 aa22.1■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 RNF19AQ9NV58 838 aa22.1■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 BARX2Q9UMQ3 279 aaPredicted RBP22.1■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 PER2O15055 1255 aa22.09■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 DARSP14868 501 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 COASYQ13057 564 aa22.09■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 TARBP2Q15633 366 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP22.09■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 ECHDC2Q86YB7 292 aa22.09■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 DAGLBQ8NCG7 672 aa22.09■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 SMRP1Q8NCR6 262 aa22.09■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 AIFM3Q96NN9 605 aa22.09■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 FGFR4P22455 802 aa22.08■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 DRP2Q13474 957 aa22.08■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 NPY5RQ15761 445 aa22.08■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 MTERF2Q49AM1 385 aa22.08■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 XKR3Q5GH77 459 aa22.08■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 B3GNT9Q6UX72 402 aa22.08■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC55Q6ZSA7 311 aa22.08■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 ABI1Q8IZP0 508 aa22.08■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 RNF169Q8NCN4 708 aa22.08■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 NLRP7Q8WX94 980 aa22.08■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 NIFKQ9BYG3 293 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.13
CXCL3-201ENST00000296026 TMEM150BA6NC51 233 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 STBD1O95210 358 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 RBM10P98175 930 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 PLCB3Q01970 1234 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 NONOQ15233 471 aaKnown RBP eCLIP22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 GALNT17Q6IS24 598 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 KCNT2Q6UVM3 1135 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 MOXD1Q6UVY6 613 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 RNF135Q8IUD6 432 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 LRRC43Q8N309 656 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 ETNPPLQ8TBG4 499 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 MBOAT7Q96N66 472 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 SH2D3AQ9BRG2 576 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 PDRG1Q9NUG6 133 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 MUTYHQ9UIF7 546 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 LZTS1Q9Y250 596 aa22.07■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 FSCN2O14926 492 aa22.06■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 DUSP6Q16828 381 aa22.06■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 INF2Q27J81 1249 aa22.06■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 KRT25Q7Z3Z0 450 aa22.06■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 VN1R2Q8NFZ6 395 aa22.06■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF558Q96NG5 402 aa22.06■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 CEP89Q96ST8 783 aa22.06■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 CDCA3Q99618 268 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 PUF60Q9UHX1 559 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 USP15Q9Y4E8 981 aaPredicted RBP22.06■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 A0A0U1RQF3 1178 aa22.05■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 FSD2A1L4K1 749 aa22.05■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 PBX3P40426 434 aa22.05■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 DNM2P50570 870 aa22.05■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 CDC42EP1Q00587 391 aa22.05■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 HERC4Q5GLZ8 1057 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 CLLU1OSQ5K130 101 aa22.05■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 PLPP4Q5VZY2 271 aa22.05■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 GCOM2Q9BZD3 368 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 DACT1Q9NYF0 836 aa22.05■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 KCNJ14Q9UNX9 436 aa22.05■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 IGKV6-21A0A0C4DH24 114 aa22.04■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 DDX11L8A8MPP1 907 aa22.04■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 EOMESO95936 686 aa22.04■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 PPM1AP35813 382 aa22.04■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP22.04■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 HELQQ8TDG4 1101 aa22.04■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 TCF25Q9BQ70 676 aa22.04■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 ENTPD7Q9NQZ7 604 aa22.04■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 A0A087WZ62 844 aa22.03■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 SLC37A4O43826 429 aa22.03■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 ATF7P17544 494 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 KRT17Q04695 432 aa22.03■■□□□ 1.12
CXCL3-201ENST00000296026 LETM2Q2VYF4 491 aa22.03■■□□□ 1.12
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