RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291892.10

RDH13-201, Transcript of retinol dehydrogenase 13, humanhuman

TSL 2

Gene RDH13, Length 3,022 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH13-201ENST00000291892 KIAA1755Q5JYT7 1200 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SNX30Q5VWJ9 437 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 LRRC57Q8N9N7 239 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 EIF1ADQ8N9N8 165 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 TXLNGQ9NUQ3 528 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 NUDT17P0C025 328 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 PHKG2P15735 406 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 RPL21P46778 160 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 DNAJC3Q13217 504 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 ACBD5Q5T8D3 534 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SPTY2D1Q68D10 685 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 SRRM1Q8IYB3 904 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 RBBP8NLQ8NC74 664 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 IQCDQ96DY2 449 aa14.65□□□□□ -0.06
RDH13-201ENST00000291892 HNRNPRO43390 633 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 KRT36O76013 467 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 ACADSP16219 412 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 SLC9A1P19634 815 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 RASA1P20936 1047 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 CYP7A1P22680 504 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 TRAPPC10P48553 1259 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 SGSM1Q2NKQ1 1148 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 ZDHHC24Q6UX98 284 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 SLCO1B3Q9NPD5 702 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 ARMCX3Q9UH62 379 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 CHORDC1Q9UHD1 332 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 LTN1O94822 1766 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 FAM196BA6NMK8 535 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 GJB6O95452 261 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 KCNJ1P48048 391 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 LRRC55Q6ZSA7 311 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 SUPV3L1Q8IYB8 786 aaKnown RBP eCLIP14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 ATL2Q8NHH9 583 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 ABTB1Q969K4 478 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 TSG101Q99816 390 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 TXLNGYQ9BZA5 131 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 NT5C3AQ9H0P0 336 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 NAGPAQ9UK23 515 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 AMFRQ9UKV5 643 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 PPP1R9AQ9ULJ8 1098 aa14.64□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 ANKRD63C9JTQ0 380 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 ATF3P18847 181 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 USP46P62068 366 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 DUPD1Q68J44 220 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 GJB7Q6PEY0 223 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 VSTM1Q6UX27 236 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 SV2BQ7L1I2 683 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 SNRNP27Q8WVK2 155 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 MRRFQ96E11 262 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 RIPK2O43353 540 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 SETSIPP0DME0 302 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 CCNB1P14635 433 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 PDIA5Q14554 519 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 TCERG1LQ5VWI1 586 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 IRGCQ6NXR0 463 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 ISLR2Q6UXK2 745 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 ADGRA1Q86SQ6 560 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 ZNF333Q96JL9 665 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 LRRC37BQ96QE4 947 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 PFASO15067 1338 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 CAPN9O14815 690 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 SPAG7O75391 227 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 AMPD3Q01432 767 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 DCAF12L1Q5VU92 463 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 OLFML2BQ68BL8 750 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 GALNT17Q6IS24 598 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 DSTYKQ6XUX3 929 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 CEP128Q6ZU80 1094 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 NT5DC3Q86UY8 548 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 BICD1Q96G01 975 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 FGFBP2Q9BYJ0 223 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 CCSER1Q9C0I3 900 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 CARD9Q9H257 536 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 ETNK2Q9NVF9 386 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 MTRF1LQ9UGC7 380 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 BLOC1S6Q9UL45 172 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 TMEM94Q12767 1356 aa14.63□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 PPAN-P2RY11A0A0B4J1V8 794 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 KIAA0391O15091 583 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 H2AFZP0C0S5 128 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 IMPDH2P12268 514 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 SKIP12755 728 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 DYNLL1P63167 89 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 H2AFVQ71UI9 128 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 NRG4Q8WWG1 115 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 PHACTR1Q9C0D0 580 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 CCDC134Q9H6E4 229 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 CHMP2BQ9UQN3 213 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 CHKBQ9Y259 395 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 FLT1P17948 1338 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 VPS41P49754 854 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 BCAMP50895 628 aa14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 PFKFB3Q16875 520 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
RDH13-201ENST00000291892 CNPY1Q3B7I2 92 aa14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.9 ms