RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000265340.11

PITX1-201, Transcript of paired like homeodomain 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PITX1, Length 2,406 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITX1-201ENST00000265340 SFMBT2Q5VUG0 894 aa23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 NEDD1Q8NHV4 660 aa23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 DYDC1Q8WWB3 177 aa23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SH2D4AQ9H788 454 aa23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SUGT1Q9Y2Z0 365 aa23.73■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 GOLGA8HP0CJ92 632 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 ZNF24P17028 368 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 COPS2P61201 443 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 PPARDQ03181 441 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 BNIP1Q12981 228 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 FOXB2Q5VYV0 432 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 USP49Q70CQ1 688 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 PODNQ7Z5L7 613 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 OR2W6PQ8NHA6 318 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 CPVLQ9H3G5 476 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 PEX5P50542 639 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 TYW1BQ6NUM6 668 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 C17orf50Q8WW18 174 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 AZIN2Q96A70 460 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 GSDMAQ96QA5 445 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 ZNHIT6Q9NWK9 470 aaKnown RBP23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SLC4A7Q9Y6M7 1214 aa23.72■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 KCNJ18B7U540 433 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 CALB2P22676 271 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 NLRP5P59047 1200 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 KCNJ12Q14500 433 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 TSNAXIP1Q2TAA8 658 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 ASRGL1Q7L266 308 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 CEP95Q96GE4 821 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 ZNF287Q9HBT7 754 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 CTNND2Q9UQB3 1225 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 MAPK8IP1Q9UQF2 711 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SRPRBQ9Y5M8 271 aaKnown RBP23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 TRIM75PA6NK02 468 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 CXCR5P32302 372 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 MTMR3Q13615 1198 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 PBKQ96KB5 322 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 RNPEPL1Q9HAU8 725 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 SCOCQ9UIL1 159 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 WDR37Q9Y2I8 494 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 PCDHAC2Q9Y5I4 1007 aa23.71■■□□□ 1.39
PITX1-201ENST00000265340 PLS1Q14651 629 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 MB21D1Q8N884 522 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 NCSTNQ92542 709 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 USP40Q9NVE5 1235 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 STK38LQ9Y2H1 464 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TMEM221A6NGB7 291 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 RAD17O75943 681 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 FAM200BP0CF97 657 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 PRELPP51888 382 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 APOBEC3HQ6NTF7 200 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 RNF168Q8IYW5 571 aaPredicted RBP23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 FAM136AQ96C01 138 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TLCD1Q96CP7 247 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CSRNP2Q9H175 543 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ISCUQ9H1K1 167 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 LRWD1Q9UFC0 647 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TSKSQ9UJT2 592 aa23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 BZW2Q9Y6E2 419 aaKnown RBP23.7■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CCDC166P0CW27 439 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 SLURP2P0DP57 97 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CDK17Q00537 523 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 GABPAQ06546 454 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TMED1Q13445 227 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CDC42EP5Q6NZY7 148 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 SH3RF1Q7Z6J0 888 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ARHGAP18Q8N392 663 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 NSRP1Q9H0G5 558 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 THAP9Q9H5L6 903 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CIDEBQ9UHD4 219 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 RWDD2AQ9UIY3 292 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 MYBP10242 640 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 GSTT1P30711 240 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ZNF174Q15697 407 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 PIK3AP1Q6ZUJ8 805 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 PTPRN2Q92932 1015 aa23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ELAC2Q9BQ52 826 aaKnown RBP23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TSPYL2Q9H2G4 693 aaPredicted RBP23.69■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 ZNF189O75820 626 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TMCC1O94876 653 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 DPYDQ12882 1025 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 SPA17Q15506 151 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 LRRC34Q8IZ02 419 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 PHC3Q8NDX5 983 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 IQCDQ96DY2 449 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 TIPINQ9BVW5 301 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CCDC134Q9H6E4 229 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 NKX1-2Q9UD57 310 aaPredicted RBP23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 DCDC2CA8MYV0 355 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 SMAPO00193 183 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 MOCS3O95396 460 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP23.68■■□□□ 1.383e-7■■□□□ 12.7
PITX1-201ENST00000265340 GJA8P48165 433 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 RAD23BP54727 409 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CYP27A1Q02318 531 aa23.68■■□□□ 1.38
PITX1-201ENST00000265340 CUL1Q13616 776 aa23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 1178.3 ms