RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000264345.7

HERC3-201, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,764 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-201ENST00000264345 KCNK9Q9NPC2 374 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 OLFML3Q9NRN5 406 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 APEX2Q9UBZ4 518 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 NOVA2Q9UNW9 492 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 GMNCA6NCL1 334 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 P4HBP07237 508 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 MYBP10242 640 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 TM4SF1P30408 202 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SHMT1P34896 483 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SLC20A2Q08357 652 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SETDB1Q15047 1291 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 XXYLT1Q8NBI6 393 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 CCHCR1Q8TD31 782 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 DNAJC19Q96DA6 116 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 AGPAT1Q99943 283 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 KCNMB3Q9NPA1 279 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ATP8A1Q9Y2Q0 1164 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ATP2C2O75185 946 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 HSPA9P38646 679 aaKnown RBP9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 RWDD2BP57060 319 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 TNFAIP1Q13829 316 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 PADI6Q6TGC4 694 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 CASKIN2Q8WXE0 1202 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 NAGPAQ9UK23 515 aa9.56□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 DOCK2Q92608 1830 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 TCP10L2B9ZVM9 353 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 THAP12O43422 761 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 NDUFB10O96000 172 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 MYCLP12524 364 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ATP2A2P16615 1042 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SLC9A1P19634 815 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SLC8A1P32418 973 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 VAMP7P51809 220 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 MESDQ14696 234 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 MAEAQ7L5Y9 396 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 PPM1KQ8N3J5 372 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ATP6V0A1Q93050 837 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ZNF653Q96CK0 615 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 A0A087X0T9 212 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 RTN2O75298 545 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 CYP3A4P08684 503 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 FAM228BP0C875 321 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 GYS1P13807 737 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 PRKCIP41743 596 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 CARSP49589 748 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 GALCP54803 685 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SLC12A3P55017 1021 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 CEP55Q53EZ4 464 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SMIM5Q71RC9 77 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ENOSF1Q7L5Y1 443 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 CDAN1Q8IWY9 1227 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 LARGE2Q8N3Y3 721 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 PIGOQ8TEQ8 1089 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 MSH4O15457 936 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 MYBL1P10243 752 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ACTN1P12814 892 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ATF2P15336 505 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 IBSPP21815 317 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ALDH3A1P30838 453 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 YWHAEP62258 255 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 MRPS25P82663 173 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 IFT88Q13099 833 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ARHGEF16Q5VV41 709 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 KRT27Q7Z3Y8 459 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 GADD45GIP1Q8TAE8 222 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 MTMR8Q96EF0 704 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 RIT2Q99578 217 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 AS3MTQ9HBK9 375 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 PACSIN2Q9UNF0 486 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ESYT3A0FGR9 886 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 RCCD1A6NED2 376 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SFNP31947 248 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 PMS2P54278 862 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 PLTPP55058 493 aa9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SYDE1Q6ZW31 735 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 INTS9Q9NV88 658 aaKnown RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 CRY2Q49AN0 593 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 RPUSD2Q8IZ73 545 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SPICE1Q8N0Z3 855 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SLC35G2Q8TBE7 412 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 RIN2Q8WYP3 895 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 DDX47Q9H0S4 455 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 CARD9Q9H257 536 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 KIAA1586Q9HCI6 787 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 EVI5O60447 810 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 PHF2O75151 1096 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 MAPTP10636 758 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SNAP25P60880 206 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 LACTBP83111 547 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 KCNMA1Q12791 1236 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 ZYXQ15942 572 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 NAA35Q5VZE5 725 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 SAMD3Q8N6K7 520 aa9.54□□□□□ -0.88
HERC3-201ENST00000264345 HAS1Q92839 578 aa9.54□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.6 ms