RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000262291.8

VMP1-201, Transcript of vacuole membrane protein 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene VMP1, Length 2,712 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VMP1-201ENST00000262291 GOLGA8JA6NMD2 632 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 CCDC169A6NNP5 214 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 LRRN2O75325 713 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 MOCS3O95396 460 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 KCNA2P16389 499 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 PON1P27169 355 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 PSMC5P62195 406 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 EXOC3L4Q17RC7 722 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 HS2ST1Q7LGA3 356 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 CCDC170Q8IYT3 715 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 CAPZA3Q96KX2 299 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 CBWD1Q9BRT8 395 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 EFCC1Q9HA90 598 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 GCNT4Q9P109 453 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 FAM184BQ9ULE4 1060 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 ODF2LQ9ULJ1 636 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 PPP2R3BQ9Y5P8 575 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 EIF3DO15371 548 aaKnown RBP eCLIP14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 EXOC3O60645 756 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 HOXA7P31268 230 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 CYFIP1Q7L576 1253 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 NEK9Q8TD19 979 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 MOV10L1Q9BXT6 1211 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 HAUS4Q9H6D7 363 aa14.85□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 FDX1P10109 184 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 HNRNPH3P31942 346 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 DLG4P78352 724 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 CCDC60Q8IWA6 550 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 TXLNBQ8N3L3 684 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 CEP170P1Q96L14 293 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 INPP4AQ96PE3 977 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 PSMB7Q99436 277 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 MAP3K20Q9NYL2 800 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 SALL4Q9UJQ4 1053 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 BUB1O43683 1085 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 PSMC2P35998 433 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 KRT76Q01546 638 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 CBWD6Q4V339 395 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 CBWD3Q5JTY5 395 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 CBWD5Q5RIA9 395 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 WDR78Q5VTH9 848 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 DPY19L2P1Q6NXN4 242 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 TMCO3Q6UWJ1 677 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 BSNDQ8WZ55 320 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 ELMO3Q96BJ8 720 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 CDCA5Q96FF9 252 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 FAM84AQ96KN4 292 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 PCDHA10Q9Y5I2 948 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 CAPN6Q9Y6Q1 641 aa14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
VMP1-201ENST00000262291 PGK2P07205 417 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 UCHL3P15374 230 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 OAS2P29728 719 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 MAGEA1P43355 309 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 VAV2P52735 878 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 FAM193AP78312 1265 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 KIF5AQ12840 1032 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 MKRN3Q13064 507 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 KLHDC7AQ5VTJ3 777 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 HAUS6Q7Z4H7 955 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 BORCS6Q96GS4 357 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 SPAG5Q96R06 1193 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 ZNF408Q9H9D4 720 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 LARSQ9P2J5 1176 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 CDC23Q9UJX2 597 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 ZNF185O15231 689 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 KRT86O43790 486 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 PLS3P13797 630 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 MUTP22033 750 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 DNA2P51530 1060 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 JAK3P52333 1124 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 OAZ1P54368 228 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 ACTR2P61160 394 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 KLHL30Q0D2K2 578 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 ASIC2Q16515 512 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 PACSIN1Q9BY11 444 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 SEL1LQ9UBV2 794 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 DBR1Q9UK59 544 aaKnown RBP14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 FRMD4BQ9Y2L6 1034 aa14.83□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 PPP1R37O75864 691 aa14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 NAP1L1P55209 391 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 CDK17Q00537 523 aa14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 C4orf19Q8IY42 314 aa14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 GPRASP2Q96D09 838 aa14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 SIX2Q9NPC8 291 aa14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 KCND2Q9NZV8 630 aa14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 A0A087X0T9 212 aa14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 SASH3O75995 380 aa14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 FAM228BP0C875 321 aa14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 CHRM1P11229 460 aaPredicted RBP14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 IREB2P48200 963 aaKnown RBP14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 PTPROQ16827 1216 aa14.82□□□□□ -0.04
VMP1-201ENST00000262291 MTERF2Q49AM1 385 aa14.82□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms